More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2001 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 
203 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  86.07 
 
 
203 aa  374  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  81.09 
 
 
203 aa  354  5e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  78.11 
 
 
203 aa  345  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  76.62 
 
 
203 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  74.13 
 
 
203 aa  333  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  74.13 
 
 
203 aa  328  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.08 
 
 
200 aa  273  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.11 
 
 
277 aa  166  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.93 
 
 
284 aa  156  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.23 
 
 
284 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.23 
 
 
284 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.78 
 
 
278 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.58 
 
 
309 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.33 
 
 
286 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.05 
 
 
298 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  40.96 
 
 
291 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.96 
 
 
291 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  40.53 
 
 
312 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.74 
 
 
283 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.16 
 
 
280 aa  144  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.63 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.58 
 
 
276 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.54 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.42 
 
 
329 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.95 
 
 
296 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.84 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.34 
 
 
306 aa  135  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.4 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.38 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.15 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.9 
 
 
288 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  43.24 
 
 
285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.31 
 
 
309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.33 
 
 
286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.28 
 
 
281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.83 
 
 
344 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.76 
 
 
294 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.66 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.22 
 
 
294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  43.97 
 
 
211 aa  124  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.96 
 
 
154 aa  122  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.62 
 
 
150 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  46.46 
 
 
211 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  47.24 
 
 
143 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  47.66 
 
 
143 aa  121  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  43.07 
 
 
142 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  42.86 
 
 
144 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.97 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.64 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.96 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.8 
 
 
131 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.8 
 
 
127 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  42.19 
 
 
145 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  44.19 
 
 
133 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  43.18 
 
 
133 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  42.97 
 
 
144 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  48.82 
 
 
122 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.75 
 
 
133 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.75 
 
 
133 aa  115  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  43.85 
 
 
133 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.11 
 
 
291 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.67 
 
 
133 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  43.85 
 
 
133 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  43.85 
 
 
133 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.6 
 
 
128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.8 
 
 
124 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  41.41 
 
 
146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  43.75 
 
 
138 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  43.65 
 
 
128 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  44.8 
 
 
128 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.8 
 
 
128 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  42.52 
 
 
129 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  44 
 
 
123 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  44.53 
 
 
138 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  44.53 
 
 
137 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1562  FeS cluster assembly scaffold IscU  43.31 
 
 
137 aa  111  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.43451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.86 
 
 
139 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  47.2 
 
 
130 aa  111  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  42.4 
 
 
132 aa  111  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  44.8 
 
 
137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  42.65 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1165  scaffold protein  43.31 
 
 
128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0089491  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  46.51 
 
 
125 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.42 
 
 
134 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  43.18 
 
 
129 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  41.35 
 
 
135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.88 
 
 
142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.98 
 
 
132 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  42.86 
 
 
135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.63 
 
 
133 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0409  scaffold protein  46.28 
 
 
138 aa  108  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  44.19 
 
 
128 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.28 
 
 
128 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  46.28 
 
 
128 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  46.28 
 
 
128 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1059  scaffold protein  41.54 
 
 
133 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  46.28 
 
 
128 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  42.62 
 
 
139 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  46.28 
 
 
128 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>