More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1980 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  100 
 
 		 460 aa  944    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  58.04 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  46.71 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  47.75 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  37.47 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  37.53 
 
 		 470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  32.88 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  35.29 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  34.19 
 
 		 490 aa  221  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  35.03 
 
 		 468 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.55 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.34 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.34 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.62 
 
 		 472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.27 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  35.07 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.15 
 
 		 480 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  31.37 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.57 
 
 		 429 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  32.61 
 
 		 741 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  36.6 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  34.63 
 
 		 439 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.73 
 
 		 441 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  32.56 
 
 		 517 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  31.15 
 
 		 569 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  30.19 
 
 		 490 aa  200  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  30.33 
 
 		 533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  35.24 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  35.24 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  31.13 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  33.61 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  34.94 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  34.6 
 
 		 523 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  33.51 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  33.25 
 
 		 441 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  32.86 
 
 		 503 aa  190  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.24 
 
 		 490 aa  189  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  32.21 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  32.02 
 
 		 475 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  32.34 
 
 		 513 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.57 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  36.92 
 
 		 498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  34.7 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  33.8 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  30.43 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  31.13 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.65 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  30.9 
 
 		 471 aa  179  9e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  31.33 
 
 		 462 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  33.33 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  30.54 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  30.24 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.98 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  30.9 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  32.52 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  35.08 
 
 		 468 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  30.34 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  34.16 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.77 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  31.66 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  32.25 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  33.54 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.77 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.17 
 
 		 482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  34.25 
 
 		 353 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.46 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  29.6 
 
 		 460 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.16 
 
 		 439 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  32.46 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  31.41 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  33.05 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  31.81 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  32.61 
 
 		 466 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  33.81 
 
 		 436 aa  171  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.37 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.37 
 
 		 477 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  30.73 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  33.33 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  28.88 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  34.14 
 
 		 465 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  37.58 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.42 
 
 		 312 aa  166  1.0000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  29.33 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  32.26 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.29 
 
 		 464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  39.53 
 
 		 380 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  40.33 
 
 		 388 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  37.21 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  43.69 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  27.63 
 
 		 692 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  35.55 
 
 		 665 aa  161  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  28.23 
 
 		 690 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  31.82 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  43.58 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  29.45 
 
 		 687 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  35.54 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  31.15 
 
 		 674 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  41.63 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  28.22 
 
 		 676 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  34.68 
 
 		 402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>