More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1970 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1970  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 372 aa  747    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000114357  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1111  rod shape-determining protein MreB  64.24 
 
 		 344 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  60.81 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  61.79 
 
 		 342 aa  421  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  60.9 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  61.79 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  61.19 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  60.6 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  61.79 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2238  rod shape-determining protein MreB  53.45 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1921  rod shape-determining protein MreB  56.5 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.55 
 
 		 336 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  47.62 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  47.58 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  45.67 
 
 		 343 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  44.48 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  43.44 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  43.17 
 
 		 358 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  45.37 
 
 		 343 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  42.15 
 
 		 342 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  46.99 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  44.19 
 
 		 342 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  46.89 
 
 		 345 aa  286  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  46.95 
 
 		 344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4777  rod shape-determining protein MreB  43.53 
 
 		 353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000529713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  46.45 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  44.84 
 
 		 349 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  43.71 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  46.75 
 
 		 343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  44.57 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  42.86 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  42.34 
 
 		 343 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  42.34 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  44.97 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  44.35 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  45.19 
 
 		 339 aa  279  7e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  44.82 
 
 		 343 aa  279  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  42.14 
 
 		 343 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  45.48 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  46.63 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.4 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  46.63 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  46.01 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  46.32 
 
 		 344 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  46.63 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  46.32 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  43.77 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  44.81 
 
 		 342 aa  276  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  46.32 
 
 		 344 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  43.31 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.6 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0149  rod shape-determining protein MreB  45.64 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.126698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  44.21 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.97 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  43.41 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  45.24 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  43.02 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  45.34 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  43.23 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  44.18 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0105  rod shape-determining protein MreB  45.27 
 
 		 350 aa  272  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1149  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  42.73 
 
 		 344 aa  272  9e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000405935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  45.07 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  42.15 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  44.18 
 
 		 347 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  45.51 
 
 		 342 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  43.43 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  42.34 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  43.24 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  44.51 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  41.72 
 
 		 344 aa  269  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  43.28 
 
 		 354 aa  268  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  43.15 
 
 		 366 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01791  rod shape-determining protein MreB  44.54 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  42.69 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0242  rod shape-determining protein MreB  44.44 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.43 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  41.84 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  43.65 
 
 		 339 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  41.12 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  43.28 
 
 		 347 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  43.28 
 
 		 347 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  43.45 
 
 		 335 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  45.71 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  43.93 
 
 		 343 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  45.71 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  43.96 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1207  rod shape-determining protein MreB  43.67 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000344928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1248  rod shape-determining protein MreB  43.67 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0105666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  43.58 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  42.31 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  41.39 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  46.01 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  44.31 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.48 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  42.73 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  43.34 
 
 		 333 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  41.95 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  41.95 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1215  rod shape-determining protein MreB  44.68 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>