130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1956 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
129 aa  267  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  69.11 
 
 
126 aa  184  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  66.95 
 
 
125 aa  166  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2568  dihydroneopterin aldolase  59.68 
 
 
125 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  61.29 
 
 
125 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2294  dihydroneopterin aldolase  55.65 
 
 
125 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.779597  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  47.41 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0233  dihydroneopterin aldolase family protein  46.83 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2247  dihydroneopterin aldolase  41.28 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  41.88 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  40 
 
 
119 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  41.03 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  39.09 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  39.09 
 
 
119 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  40.37 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  42.72 
 
 
126 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  36.75 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  41.28 
 
 
119 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  38.54 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  36.36 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
120 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  35.35 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  34.55 
 
 
116 aa  77  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  35.09 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  36.46 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  36.94 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  34.34 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  34.19 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  33.01 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  31.31 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  32.43 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  43.14 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  35.85 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  37.86 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  31.53 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  29.46 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  33.9 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0070  dihydroneopterin aldolase  38.38 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.14 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1014  dihydroneopterin aldolase  32.2 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  30.36 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  33.04 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03415  FolB  33.98 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  28.33 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  28.33 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  39.6 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  32.35 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  27.1 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  31.37 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1274  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.436023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.21 
 
 
292 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  31.37 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  27.68 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  34.02 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  34.65 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  29.41 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  31.07 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  28.44 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  31.68 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  27.45 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  32.67 
 
 
841 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  28.43 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  25.62 
 
 
125 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  31.68 
 
 
310 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  34.65 
 
 
525 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
470 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  29.7 
 
 
1211 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33546  predicted protein  31.96 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183878  hitchhiker  0.00808853 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  30.17 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  32.04 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0591  dihydroneopterin aldolase  30.77 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.503596  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  32.86 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  31.73 
 
 
124 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  23.68 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  30.28 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  31.19 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  30.36 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  23.85 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.66 
 
 
612 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  26.09 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2328  dihydroneopterin aldolase  29.7 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00313661  normal  0.014777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  23.97 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  29.79 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>