More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1908 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
991 aa  2032  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
985 aa  726  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.15 
 
 
993 aa  929  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
990 aa  719  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
967 aa  644  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  1.33293e-06 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
812 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
1040 aa  418  1e-115  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1369 aa  401  1e-110  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.4 
 
 
1397 aa  398  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
1069 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.88 
 
 
1014 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.33 
 
 
1499 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1550 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
977 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
925 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.93 
 
 
1398 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 
950 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
816 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
1118 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
758 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
936 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
1240 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1820 aa  362  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
705 aa  361  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.4 
 
 
1331 aa  358  2e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  40.03 
 
 
1346 aa  359  2e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 
929 aa  358  2e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
916 aa  358  3e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  39.66 
 
 
977 aa  357  6e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.77 
 
 
1442 aa  357  9e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
1090 aa  356  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
921 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  40.36 
 
 
847 aa  352  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
1255 aa  351  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
946 aa  351  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.22 
 
 
852 aa  350  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.34 
 
 
1177 aa  350  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  37.77 
 
 
765 aa  349  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
1363 aa  347  9e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.02 
 
 
1135 aa  346  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1202 aa  343  7e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
1267 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1305 aa  342  3e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  37 
 
 
1030 aa  341  3e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1692 aa  340  9e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
1326 aa  338  2e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  37.15 
 
 
2035 aa  338  3e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1072 aa  338  3e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
801 aa  338  3e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.21 
 
 
2213 aa  338  4e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.26448e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  35.8 
 
 
1021 aa  338  4e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
835 aa  337  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1765 aa  336  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1266 aa  335  3e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 
1768 aa  335  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  34.1 
 
 
850 aa  334  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  40.97 
 
 
1763 aa  333  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.43 
 
 
1574 aa  333  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
887 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  40.11 
 
 
1407 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1384 aa  330  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 
920 aa  328  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  37.8 
 
 
833 aa  327  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 
1313 aa  327  8e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
1240 aa  325  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 
1245 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  34.19 
 
 
1653 aa  325  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
2654 aa  324  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  35.81 
 
 
1001 aa  323  1e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1033 aa  322  2e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  29.47 
 
 
1179 aa  321  4e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.15 
 
 
1109 aa  321  4e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 
1165 aa  321  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
957 aa  321  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.17317e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1582 aa  321  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  2.34203e-05 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 
1284 aa  320  8e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  37.98 
 
 
590 aa  320  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
909 aa  318  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
738 aa  318  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  38.72 
 
 
1322 aa  317  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
1767 aa  317  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1234 aa  317  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  28.69 
 
 
1683 aa  317  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
928 aa  317  1e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
1340 aa  317  1e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
1767 aa  317  1e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  31.49 
 
 
1626 aa  316  1e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 
1303 aa  316  2e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  30.48 
 
 
1439 aa  315  2e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.94 
 
 
923 aa  315  2e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  37.39 
 
 
1351 aa  315  2e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.2 
 
 
1765 aa  315  3e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
1245 aa  315  3e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
1643 aa  315  3e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
721 aa  314  4e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1771 aa  315  4e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
1603 aa  314  5e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1480 aa  314  5e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
1767 aa  314  6e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
682 aa  313  7e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>