34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1900 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  64.22 
 
 		 225 aa  285  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  56.28 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  54.42 
 
 		 218 aa  256  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  45.97 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  38.97 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1503  protein of unknown function DUF975  34.27 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2424  hypothetical protein  31.52 
 
 		 267 aa  104  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.129436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  29.2 
 
 		 245 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  29.2 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  27.18 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  30.49 
 
 		 335 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  28.57 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  32.06 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0167  putative transmembrane protein  25.53 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  31.62 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0384  hypothetical protein  21.93 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  26.39 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  43.56 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  22.27 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3976  ParB-like partition protein  25.59 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.180656 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  21.59 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1749  hypothetical protein  21.96 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000252365  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0425  hypothetical membrane spanning protein  21.5 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.800318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  21.28 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  24.68 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  25.66 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  26.61 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  35.29 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  29.29 
 
 		 311 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>