15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1899 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1899  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.201368  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2097  hypothetical protein  58.84 
 
 
321 aa  345  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1581  hypothetical protein  41.58 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.518967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1734  hypothetical protein  37.59 
 
 
273 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0059  hypothetical protein  28.27 
 
 
268 aa  126  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0434  hypothetical protein  26.91 
 
 
261 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1084  hypothetical protein  29.65 
 
 
245 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1876  hypothetical protein  28.12 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1695  hypothetical protein  25.55 
 
 
246 aa  92  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1586  hypothetical protein  27.8 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0196619  normal  0.892505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1491  hypothetical protein  26.29 
 
 
246 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1428  hypothetical protein  25.99 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0850  hypothetical protein  28.71 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00832469  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1927  hypothetical protein  25.45 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000210068  hitchhiker  0.00302398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2010  hypothetical protein  27.83 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>