47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1896 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1896  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  497  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00275112  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2096  hypothetical protein  62.1 
 
 
226 aa  274  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.565676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2070  hypothetical protein  55.46 
 
 
241 aa  259  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00317264  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2143  hypothetical protein  54.66 
 
 
242 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00274406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2471  hypothetical protein  51.08 
 
 
241 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0312  hypothetical protein  58.29 
 
 
235 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1766  hypothetical protein  43.32 
 
 
241 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3936  hypothetical protein  50.56 
 
 
251 aa  198  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186569  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2251  hypothetical protein  47.26 
 
 
244 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279763  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00823  hypothetical protein  47.22 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00889031  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1401  hypothetical protein  43.72 
 
 
240 aa  177  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.779374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3138  hypothetical protein  48.91 
 
 
255 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4302  hypothetical protein  44.74 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06151  hypothetical protein  44.94 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2371  hypothetical protein  40.09 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.034488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000344  hypothetical protein  48.48 
 
 
174 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1656  hypothetical protein  42.01 
 
 
225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4792  hypothetical protein  41.23 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1662  hypothetical protein  42.47 
 
 
225 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3377  hypothetical protein  51.33 
 
 
237 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0981  hypothetical protein  41.07 
 
 
241 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0750198 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1457  hypothetical protein  39.65 
 
 
248 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1201  hypothetical protein  40.98 
 
 
247 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00176822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41200  hypothetical protein  39.73 
 
 
236 aa  158  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54820  hypothetical protein  44.13 
 
 
245 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000122092  hitchhiker  1.1630299999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1780  hypothetical protein  39.49 
 
 
238 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1416  hypothetical protein  44.22 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.154846  normal  0.0419171 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1279  hypothetical protein  41.15 
 
 
215 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.164553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1340  hypothetical protein  41.15 
 
 
215 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2158  hypothetical protein  45.51 
 
 
407 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2132  hypothetical protein  44.87 
 
 
407 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1090  hypothetical protein  40.74 
 
 
414 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.448834  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0983  hypothetical protein  41.51 
 
 
414 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0681  hypothetical protein  37.84 
 
 
208 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.785477  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1799  hypothetical protein  40.12 
 
 
239 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1362  hypothetical protein  44.63 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0870549  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1647  twin-arginine translocation pathway signal  41.96 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0554  hypothetical protein  40.82 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0865  hypothetical protein  39.46 
 
 
213 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175184  normal  0.0645858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4407  hypothetical protein  40.14 
 
 
202 aa  92  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.386078  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2211  hypothetical protein  45.08 
 
 
208 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1827  twin-arginine translocation pathway signal  33.72 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0428  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3199  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3982  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.496896  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3600  hypothetical protein  35.25 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1704  hypothetical protein  28.12 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.179942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>