More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1877 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  100 
 
 		 475 aa  994    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  58.32 
 
 		 471 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  51.91 
 
 		 468 aa  478  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  51.39 
 
 		 473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  49.36 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  54.01 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  45.02 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  34.51 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  33.64 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  34.88 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  33.73 
 
 		 414 aa  243  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  32.25 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  31.11 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  30.79 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.58 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.58 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  30.79 
 
 		 460 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.35 
 
 		 452 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  31.18 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  31.34 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  31.41 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.03 
 
 		 440 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  29.79 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  30.87 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  30.47 
 
 		 452 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.26 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.15 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  32.87 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3407  isochorismate synthase, menaquinone-specific  32.17 
 
 		 431 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2562  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.93 
 
 		 431 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.436798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3015  isochorismate synthase  33.02 
 
 		 441 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2644  isochorismate synthase, menaquinone-specific  31.93 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.181423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02192  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.7 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1392  isochorismate synthase  31.7 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.310179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2411  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.7 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.711166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02151  hypothetical protein  31.7 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.392622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1383  isochorismate synthase  31.7 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2420  isochorismate synthase, menaquinone-specific  31.7 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.37861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  29.43 
 
 		 435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1110  isochorismate synthase  31.72 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  32.3 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.21 
 
 		 455 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2550  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.34 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.920817  normal  0.811222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2538  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.34 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2495  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.34 
 
 		 431 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  31.21 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  31.82 
 
 		 455 aa  196  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2446  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.34 
 
 		 431 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  30.86 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2654  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.11 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.253728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  31.4 
 
 		 471 aa  195  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.8 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  33.42 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  29.08 
 
 		 460 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  30.66 
 
 		 432 aa  186  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  34.25 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0618  isochorismate synthase  29.54 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.734802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  32.53 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  32.29 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  30.88 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  31.57 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  29.2 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  30.62 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2815  isochorismate synthase  31.12 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.96 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  32.87 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  31.31 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  31.81 
 
 		 466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.64 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  31.71 
 
 		 466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.08 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.08 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.23 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.51 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.23 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.51 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.04 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.74 
 
 		 464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.23 
 
 		 464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.23 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.56 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  30.3 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  30.56 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  31.37 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.02 
 
 		 471 aa  153  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  28.67 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  28.67 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  30.62 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  31.47 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.07 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.07 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  38.52 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.91 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  29.97 
 
 		 475 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  31.41 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  34.58 
 
 		 259 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.63 
 
 		 492 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  33.7 
 
 		 391 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  29.63 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>