299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1831 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
387 aa  785    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  51.53 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  43.3 
 
 
359 aa  326  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  43.61 
 
 
360 aa  322  5e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  44.57 
 
 
358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  42.34 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  40.67 
 
 
359 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  30.92 
 
 
361 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  25.77 
 
 
359 aa  162  8.000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 
360 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  26.87 
 
 
360 aa  149  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  29.69 
 
 
359 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 
360 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  29.61 
 
 
360 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  28.81 
 
 
359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 
358 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 
362 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.76 
 
 
359 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 
367 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  28.45 
 
 
358 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 
356 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  28.02 
 
 
362 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 
359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  23.42 
 
 
359 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 
792 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 
359 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 
358 aa  107  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.19 
 
 
395 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  25.47 
 
 
391 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 
395 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  26.88 
 
 
392 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 
1111 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 
1061 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 
1061 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  24.87 
 
 
357 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 
389 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 
374 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 
364 aa  88.6  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 
1040 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.47 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  23.06 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  21.31 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.87 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  25.5 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  24.8 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 
1096 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  22.84 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  24.23 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  21.87 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.53 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  21.86 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.24 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  24.93 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  25 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  23.91 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  23.26 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  21.43 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  26.28 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.85 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.88 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  21.49 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  24.83 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  24.21 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.96 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  23.91 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  20.77 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  22.02 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  22.86 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  22.04 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.6 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.12 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  20.57 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  22.11 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  21.58 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  23.16 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>