More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1792 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1792  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 
407 aa  797  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  8.20178e-10  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  77.4 
 
 
408 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  62.41 
 
 
407 aa  500  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  4.05805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  61.92 
 
 
407 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  62.56 
 
 
408 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  1.26174e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  58.62 
 
 
421 aa  484  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  62.72 
 
 
412 aa  470  1e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  39.21 
 
 
426 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0190  cell cycle protein  35.66 
 
 
429 aa  235  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0469067  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0631  rod shape-determining protein RodA  39.6 
 
 
418 aa  234  2e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3304  rod shape-determining protein  34.78 
 
 
434 aa  232  7e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  40.5 
 
 
421 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0245  hypothetical protein  35.28 
 
 
429 aa  226  4e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1454  cell cycle protein  35.06 
 
 
411 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  39.34 
 
 
423 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.63 
 
 
365 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.37002e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0155  cell cycle protein  35.78 
 
 
429 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.22 
 
 
380 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  35.9 
 
 
366 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2014  rod shape-determining protein RodA  35.36 
 
 
427 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.82 
 
 
378 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.11075e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  37.6 
 
 
422 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  37.85 
 
 
422 aa  217  3e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 
378 aa  215  1e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  34.96 
 
 
421 aa  215  1e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 
417 aa  213  4e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 
417 aa  213  4e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  35.66 
 
 
366 aa  213  5e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.22 
 
 
417 aa  213  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  34.68 
 
 
366 aa  212  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  37.78 
 
 
422 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  35.62 
 
 
379 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  34.92 
 
 
367 aa  211  3e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  35.62 
 
 
379 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  34.55 
 
 
373 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.47199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  34.16 
 
 
419 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  34.33 
 
 
388 aa  209  7e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1377  cell cycle protein  34.26 
 
 
451 aa  209  9e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1353  rod shape-determining protein RodA  33.41 
 
 
433 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  36.36 
 
 
369 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 
366 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  37.17 
 
 
426 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 
371 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  34.72 
 
 
373 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  33 
 
 
379 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 
371 aa  206  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  34.38 
 
 
379 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  36.87 
 
 
412 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  33.92 
 
 
368 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  1.62732e-09 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  35.17 
 
 
373 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  31.37 
 
 
438 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  35.25 
 
 
368 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 
368 aa  203  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1928  cell division protein  33.66 
 
 
412 aa  202  8e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.229986  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  35.58 
 
 
382 aa  202  1e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  34.76 
 
 
387 aa  202  1e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  33 
 
 
371 aa  201  1e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  32.39 
 
 
368 aa  201  2e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 
368 aa  200  4e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.28961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 
386 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 
368 aa  199  8e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.16 
 
 
366 aa  198  1e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 
367 aa  198  1e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 
367 aa  198  2e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 
368 aa  197  2e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  4.70166e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  36.99 
 
 
382 aa  197  2e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.03 
 
 
367 aa  198  2e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.70795e-05  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 
368 aa  197  2e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  34.67 
 
 
376 aa  197  2e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.83195e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 
368 aa  197  2e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.82573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 
368 aa  197  2e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.78779e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  35.51 
 
 
368 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.82729e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 
373 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 
373 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  36.29 
 
 
368 aa  196  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.43295e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.78 
 
 
366 aa  196  8e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  34.46 
 
 
372 aa  196  8e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  33.85 
 
 
371 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00585  putative transmembrane rod shape-determining protein  34.74 
 
 
417 aa  195  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.510358  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  35.53 
 
 
404 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  2.23269e-06 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  35.32 
 
 
362 aa  195  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 
390 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  35.07 
 
 
366 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  34.47 
 
 
374 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 
387 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.24977e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  32.36 
 
 
376 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  34.75 
 
 
382 aa  192  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2500  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 
382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3114  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 
382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3130  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 
382 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.416509  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  35.1 
 
 
384 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  35.84 
 
 
370 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  35.84 
 
 
370 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.37698e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  35.84 
 
 
370 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  33.8 
 
 
412 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  35.84 
 
 
370 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.39344e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  35.84 
 
 
370 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  35.84 
 
 
370 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.09378e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3052  rod shape-determining protein RodA  34.95 
 
 
382 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125745  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22691  cell division membrane protein  34.24 
 
 
427 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.260767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>