More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1775 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
803 aa  1645    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  76.52 
 
 
803 aa  1197    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  55.03 
 
 
795 aa  822    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  40.33 
 
 
819 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  40.42 
 
 
814 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0764  protein-tyrosine kinase  38.24 
 
 
763 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0280941  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.09 
 
 
790 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
804 aa  228  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  26.06 
 
 
790 aa  224  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
730 aa  217  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.23 
 
 
806 aa  212  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.47 
 
 
741 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.44 
 
 
720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.87 
 
 
721 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.2 
 
 
753 aa  191  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.96 
 
 
756 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.16 
 
 
734 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.93 
 
 
750 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.34 
 
 
743 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.16 
 
 
496 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.88 
 
 
755 aa  177  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.47 
 
 
736 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.36 
 
 
722 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.62 
 
 
772 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  26.59 
 
 
745 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.4 
 
 
820 aa  171  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.29 
 
 
745 aa  171  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  26.56 
 
 
742 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  23.33 
 
 
772 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  41.36 
 
 
217 aa  170  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  29.1 
 
 
746 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  26.53 
 
 
786 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.91 
 
 
217 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.07 
 
 
464 aa  168  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  29.3 
 
 
747 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 
738 aa  167  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  25.61 
 
 
736 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24.66 
 
 
794 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
731 aa  165  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  28.12 
 
 
719 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.13 
 
 
774 aa  164  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.9 
 
 
779 aa  164  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  24.73 
 
 
747 aa  164  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.01 
 
 
726 aa  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  27.93 
 
 
719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  28.41 
 
 
720 aa  163  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  22.56 
 
 
783 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  27.93 
 
 
719 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  27.93 
 
 
719 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.29 
 
 
235 aa  162  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  27.93 
 
 
719 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  25.31 
 
 
759 aa  162  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.62 
 
 
756 aa  161  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  25.06 
 
 
753 aa  161  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.52 
 
 
737 aa  160  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  28.22 
 
 
720 aa  160  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  28.27 
 
 
720 aa  160  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  28.03 
 
 
720 aa  160  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  28.27 
 
 
720 aa  160  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  28.22 
 
 
720 aa  160  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  32.59 
 
 
521 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  39.57 
 
 
472 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  32.4 
 
 
505 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  28.18 
 
 
815 aa  157  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  31.11 
 
 
720 aa  157  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  24.07 
 
 
802 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  34.6 
 
 
508 aa  157  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  28.03 
 
 
720 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  28.03 
 
 
720 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  25.28 
 
 
734 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.89 
 
 
726 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  29.89 
 
 
726 aa  155  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  29.89 
 
 
726 aa  155  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  30 
 
 
739 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.89 
 
 
726 aa  155  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.89 
 
 
726 aa  154  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.89 
 
 
726 aa  155  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.89 
 
 
726 aa  155  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.89 
 
 
726 aa  155  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  32 
 
 
723 aa  154  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.26 
 
 
454 aa  154  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  40.8 
 
 
246 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  29.72 
 
 
726 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  27.96 
 
 
667 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  40.1 
 
 
252 aa  152  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  23.5 
 
 
767 aa  151  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  23.62 
 
 
734 aa  151  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.06 
 
 
741 aa  151  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  25.28 
 
 
784 aa  151  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.77 
 
 
746 aa  151  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.82 
 
 
741 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  28.82 
 
 
741 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  28.82 
 
 
741 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  24.21 
 
 
736 aa  150  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.42 
 
 
741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.24 
 
 
739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.97 
 
 
736 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  41.79 
 
 
205 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  32.56 
 
 
529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.05 
 
 
739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>