More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1709 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_2181  isoleucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
1033 aa  800  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1029  isoleucyl-tRNA synthetase  42 
 
 
1048 aa  825  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0101306  decreased coverage  0.00249031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1991  isoleucyl-tRNA synthetase  73.43 
 
 
1086 aa  1696  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.670114  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0592  isoleucyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
1135 aa  958  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27300  isoleucyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
1060 aa  680  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.712864  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5739  isoleucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
1073 aa  759  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155547  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5753  isoleucyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
1037 aa  663  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0420  isoleucyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
1129 aa  910  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.140403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4664  isoleucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
1143 aa  931  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0311577  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2568  isoleucyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 
1098 aa  635  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
1037 aa  804  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2374  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
1046 aa  768  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.59228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2550  isoleucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
1039 aa  884  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1424  isoleucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
1069 aa  813  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292782  normal  0.0637422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2916  isoleucyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
1059 aa  816  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00208386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2048  isoleucyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
1077 aa  1072  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3007  isoleucyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 
1078 aa  655  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5889  isoleucyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
1031 aa  654  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0801018  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1101  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
1091 aa  788  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288529  normal  0.0200655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2428  isoleucyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
1068 aa  876  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3676  isoleucyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
1110 aa  949  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2865  isoleucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
1039 aa  884  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0436  isoleucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
1108 aa  919  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.31942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3487  isoleucyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
1059 aa  646  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29824  predicted protein  36.6 
 
 
1177 aa  660  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.981906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3866  isoleucyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
1059 aa  655  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.265551  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1429  isoleucyl-tRNA synthetase  49.44 
 
 
975 aa  872  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3832  isoleucyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
1091 aa  865  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2323  isoleucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
1033 aa  814  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00762761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2014  isoleucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
1033 aa  806  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.987236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2287  isoleucyl-tRNA synthetase  74.49 
 
 
1085 aa  1708  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00241936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1709  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
1080 aa  2223  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.89774e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1887  isoleucyl-tRNA synthetase  78.87 
 
 
1080 aa  1805  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0011361  decreased coverage  0.00457118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5088  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
1081 aa  791  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00024165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2186  isoleucyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
1033 aa  798  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.330623  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
1042 aa  783  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0704  isoleucyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
1133 aa  951  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0920  isoleucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
1014 aa  755  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000204285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
1066 aa  830  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0727  isoleucyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
1069 aa  852  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.3975  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2971  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
1061 aa  824  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0600156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3853  isoleucyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
1056 aa  747  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00150354  decreased coverage  2.25829e-08 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2201  isoleucyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
1033 aa  805  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.14459e-08 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3131  isoleucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
1033 aa  802  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0622946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0322  isoleucyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
1079 aa  846  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204908  normal  0.140126 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1773  isoleucyl-tRNA synthetase  73.17 
 
 
1084 aa  1687  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0211467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4830  isoleucyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
1075 aa  761  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00601966  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0423  isoleucyl-tRNA synthetase  73.55 
 
 
1089 aa  1694  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.844237  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1596  isoleucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
1137 aa  911  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1416  isoleucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
1050 aa  793  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.14603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0044  isoleucyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 
1148 aa  949  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2663  isoleucyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
1100 aa  751  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5846  isoleucyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
1049 aa  852  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.856436  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1360  isoleucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
1093 aa  768  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0502657  normal  0.211718 
 
 
-
 
NC_002620  TC0288  isoleucyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
1036 aa  764  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1038  isoleucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
1014 aa  769  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.738889  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0154  isoleucyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
1024 aa  842  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.4137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0907  isoleucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
1066 aa  799  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236278  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1120  isoleucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
1060 aa  811  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.774761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3252  isoleucyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
1051 aa  770  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0523  isoleucyl-tRNA synthetase  73.47 
 
 
1083 aa  1677  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.750565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1977  isoleucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
1033 aa  809  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2027  isoleucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
1033 aa  800  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00705  isoleucyl-tRNA synthetase ,cytoplasmic (AFU_orthologue; AFUA_1G13710)  37.72 
 
 
1077 aa  654  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1455  isoleucyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
1072 aa  660  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.79812  normal  0.434557 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02490  isoleucyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
1134 aa  961  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2036  isoleucyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
1091 aa  756  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00485775  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1995  isoleucyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
1033 aa  805  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2880  isoleucyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
1054 aa  773  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.648909  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2241  isoleucyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
1033 aa  811  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.814784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0688  isoleucyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
1048 aa  651  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.973348  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_908  isoleucyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
1014 aa  773  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0001157  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11569  isoleucyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
1041 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3498  isoleucyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
1085 aa  635  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.714166  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
1049 aa  635  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2769  isoleucyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
1082 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2636  isoleucyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
1050 aa  634  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1198  isoleucyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
1061 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.649933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3120  isoleucyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
1047 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0513473  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3160  isoleucyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
1044 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.740282  normal  0.237708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3644  isoleucyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
1042 aa  632  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90813  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83229  isoleucyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
1082 aa  632  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0118016  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0423  isoleucyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 
1111 aa  632  1e-179  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3100  isoleucyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
1044 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23920  Isoleucyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
1122 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.173224  normal  0.725229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0970  isoleucyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 
1072 aa  629  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.853285  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119549  Isoleucine-tRNA synthetase  36.39 
 
 
1136 aa  628  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
1107 aa  623  1e-177  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09150  isoleucyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
1137 aa  625  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65472  normal  0.177586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3793  isoleucyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
1067 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.578218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1148  isoleucyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 
1123 aa  610  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.958416  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0538  isoleucyl-tRNA synthetase  32.48 
 
 
1109 aa  606  1e-172  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02290  isoleucine-tRNA ligase, putative  34.57 
 
 
1094 aa  608  1e-172  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.195709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2398  isoleucyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
1109 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.105251  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1212  isoleucyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
1072 aa  598  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0537  isoleucyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
1045 aa  590  1e-167  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09860  Isoleucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
1101 aa  585  1e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10050  isoleucyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
1138 aa  577  1e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3613  isoleucyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
1058 aa  576  1e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2152  isoleucyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
1113 aa  576  1e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.13262e-10 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>