More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1673 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.67 
 
 		 568 aa  795    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 570 aa  1172    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.35 
 
 		 571 aa  697    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0462  RecJ exonuclease  60.11 
 
 		 571 aa  694    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  55.11 
 
 		 568 aa  644    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.07 
 
 		 573 aa  687    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133994  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.65 
 
 		 574 aa  719    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.52 
 
 		 570 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  41.58 
 
 		 568 aa  465  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.38 
 
 		 568 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  40.77 
 
 		 574 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.44 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.07 
 
 		 567 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.21 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  41.42 
 
 		 566 aa  434  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.64 
 
 		 568 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.36 
 
 		 578 aa  422  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.26 
 
 		 564 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.28 
 
 		 885 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.12 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.39 
 
 		 584 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.31 
 
 		 788 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.21 
 
 		 831 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.26 
 
 		 785 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  39.89 
 
 		 578 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.66 
 
 		 574 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.93 
 
 		 827 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.12 
 
 		 566 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.48 
 
 		 907 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  37.75 
 
 		 566 aa  361  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.82 
 
 		 579 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.03 
 
 		 566 aa  360  5e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.59 
 
 		 811 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.26 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.12 
 
 		 814 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 572 aa  356  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.93 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.68 
 
 		 586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.3 
 
 		 779 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.13 
 
 		 779 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.03 
 
 		 989 aa  348  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.99 
 
 		 572 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 773 aa  347  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.45 
 
 		 599 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.71 
 
 		 732 aa  346  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.55 
 
 		 573 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.55 
 
 		 564 aa  346  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 779 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 779 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.55 
 
 		 573 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.95 
 
 		 779 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.75 
 
 		 801 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.6 
 
 		 573 aa  343  5.999999999999999e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.78 
 
 		 779 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.6 
 
 		 779 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.6 
 
 		 779 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.29 
 
 		 757 aa  340  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.6 
 
 		 779 aa  340  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.59 
 
 		 955 aa  340  5e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.6 
 
 		 779 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.34 
 
 		 569 aa  339  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  34.51 
 
 		 742 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.4 
 
 		 955 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000605261  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.16 
 
 		 582 aa  333  4e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  36.6 
 
 		 736 aa  332  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.96 
 
 		 798 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.49 
 
 		 573 aa  326  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.2 
 
 		 977 aa  325  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.68 
 
 		 583 aa  323  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  34.92 
 
 		 655 aa  322  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  34.38 
 
 		 592 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2314  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.27 
 
 		 560 aa  321  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.843202  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  35.08 
 
 		 756 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 757 aa  320  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.22 
 
 		 757 aa  320  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  35.23 
 
 		 932 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.78 
 
 		 1120 aa  319  1e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.27 
 
 		 911 aa  316  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.97 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.9 
 
 		 573 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 		 883 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.44 
 
 		 1102 aa  314  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0138959 
 
 
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NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.09 
 
 		 1035 aa  312  7.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.75 
 
 		 592 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  37.36 
 
 		 584 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.92 
 
 		 592 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.12 
 
 		 576 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.38 
 
 		 576 aa  306  6e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.52 
 
 		 580 aa  306  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  36.93 
 
 		 577 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  35.32 
 
 		 565 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  36.93 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  34.93 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  36.93 
 
 		 577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  36.83 
 
 		 577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  36.93 
 
 		 577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.05 
 
 		 577 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  36.74 
 
 		 577 aa  303  7.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  35.23 
 
 		 566 aa  303  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
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NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.03 
 
 		 573 aa  303  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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