More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1668 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.07141e-10  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  70.79 
 
 
309 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  72.86 
 
 
287 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  69.64 
 
 
288 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  66.67 
 
 
293 aa  400  1e-110  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  65.95 
 
 
288 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 
284 aa  345  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 
284 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 
289 aa  337  1e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  53.38 
 
 
284 aa  329  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
284 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 
284 aa  326  3e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
284 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
296 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
284 aa  305  8e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 
283 aa  301  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 
287 aa  298  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 
296 aa  299  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  51.6 
 
 
287 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 
284 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
299 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 
286 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 
286 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
300 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  50.52 
 
 
286 aa  286  3e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
282 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
282 aa  285  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  48.11 
 
 
287 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
284 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  51.42 
 
 
295 aa  284  1e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
286 aa  282  4e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 
300 aa  282  4e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.3119e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
294 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
294 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
294 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
289 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
287 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 
294 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
289 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
283 aa  279  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 
294 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 
290 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 
283 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
287 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
287 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 
282 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
282 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  47.62 
 
 
297 aa  275  9e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  48.59 
 
 
287 aa  274  1e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 
283 aa  274  1e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  47.75 
 
 
307 aa  274  1e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 
282 aa  274  1e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
294 aa  273  2e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 
284 aa  273  2e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 
284 aa  273  2e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
294 aa  273  2e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  49.3 
 
 
287 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 
284 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.81715e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 
289 aa  272  5e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 
282 aa  271  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  47.55 
 
 
288 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
287 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  47.67 
 
 
282 aa  271  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 
284 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
282 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 
287 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
285 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0496  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 
293 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.275042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
284 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 
287 aa  270  3e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 
289 aa  269  3e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
284 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 
284 aa  269  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 
281 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  48.92 
 
 
297 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 
285 aa  269  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  44.48 
 
 
294 aa  269  5e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
296 aa  268  6e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  45.67 
 
 
289 aa  268  8e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  45.61 
 
 
307 aa  268  8e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 
287 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 
285 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  44.84 
 
 
293 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 
290 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 
295 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 
283 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  46.18 
 
 
295 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 
288 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 
288 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 
285 aa  266  3e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 
284 aa  266  3e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 
288 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
294 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0607  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
293 aa  265  6e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 
288 aa  265  6e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0777  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
293 aa  265  6e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0591  formyltetrahydrofolate deformylase  49.13 
 
 
293 aa  265  6e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232311  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 
282 aa  265  8e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  47.12 
 
 
298 aa  265  9e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  47.29 
 
 
288 aa  265  9e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>