More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1660 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1660  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 404 aa  836    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1781  aminotransferase class I and II  75.99 
 
 		 405 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1803  aminotransferase class I and II  57.95 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  45.04 
 
 		 404 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0177  alanine aminotransferase  37.08 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.127101 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0027  alanine aminotransferase  38.89 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  40.55 
 
 		 412 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1830  aminotransferase AlaT  39.1 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  39.25 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1563  aminotransferase AlaT  39.4 
 
 		 404 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  39.5 
 
 		 426 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2267  aminotransferase AlaT  38.94 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0850565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5139  aminotransferase class I and II  37.47 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0461  aminotransferase class I and II  39.12 
 
 		 418 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  37.28 
 
 		 426 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1565  aminotransferase class I and II  38.46 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0064  aminotransferase AlaT  38.77 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01427  aminotransferase AlaT  38.65 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  39.34 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1772  aminotransferase AlaT  37.34 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1348  aminotransferase AlaT  37.35 
 
 		 410 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.613177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  38.5 
 
 		 409 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  35.78 
 
 		 518 aa  265  8e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16360  aminotransferase  38.33 
 
 		 412 aa  265  8.999999999999999e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2048  aminotransferase AlaT  37.88 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000163504  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2340  aminotransferase AlaT  38 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599264  hitchhiker  0.0000284015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1697  aminotransferase AlaT  38.69 
 
 		 404 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00135773  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  37.63 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2723  aminotransferase class I and II  38.21 
 
 		 414 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0717  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  38.4 
 
 		 546 aa  263  4e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.890628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2397  aminotransferase AlaT  40.05 
 
 		 415 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  38.13 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0692  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  38.4 
 
 		 545 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1907  aminotransferase AlaT  38.38 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0371562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0691  aminotransferase class I and II  37.44 
 
 		 410 aa  263  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0228341  hitchhiker  0.0000000562842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01072  aminotransferase AlaT  37.19 
 
 		 406 aa  262  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2838  aminotransferase AlaT  38.5 
 
 		 406 aa  263  6e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00546919  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2233  aminotransferase AlaT  40.05 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2271  aminotransferase AlaT  40.05 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2483  aminotransferase AlaT  38.19 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1872  aminotransferase AlaT  38.44 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1914  aminotransferase AlaT  37.44 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000233272  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2382  aminotransferase AlaT  40.2 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378637  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2040  aminotransferase AlaT  38.19 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00341686  hitchhiker  0.00762729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2145  aminotransferase AlaT  38.19 
 
 		 404 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0123768  normal  0.013049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  37.84 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2136  aminotransferase AlaT  37.44 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000003299  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  38.19 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3232  aminotransferase AlaT  37.92 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00114602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7259  aminotransferase AlaT  37.04 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  38.25 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2235  aminotransferase AlaT  37.44 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000654312  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4521  aminotransferase AlaT  37.44 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2186  aminotransferase AlaT  37.44 
 
 		 404 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116007  hitchhiker  0.0000796171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2248  aminotransferase AlaT  37.44 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000013752  hitchhiker  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1805  aminotransferase AlaT  39.7 
 
 		 416 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605572  hitchhiker  0.00221354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0930  aminotransferase AlaT  39.76 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.703873  normal  0.497759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1475  aminotransferase AlaT  36.93 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2553  aminotransferase AlaT  37.5 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000352326 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0815  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  36.91 
 
 		 543 aa  257  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1914  aminotransferase class I and II  37.44 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3795  aminotransferase AlaT  36.84 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1097  aminotransferase AlaT  38.15 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.832418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2034  aminotransferase AlaT  35.59 
 
 		 409 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  36.25 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  36.78 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1765  aminotransferase AlaT  38.81 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436136  normal  0.213535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0618  aminotransferase AlaT  38.02 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647931  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4338  aminotransferase class I and II  39.21 
 
 		 440 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004034  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  38.68 
 
 		 377 aa  252  6e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1468  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  37.28 
 
 		 534 aa  252  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.64807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1237  aminotransferase AlaT  37.82 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169651 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1676  aminotransferase AlaT  35.16 
 
 		 403 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000605131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0279  aminotransferase AlaT  37.9 
 
 		 422 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.306917  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1164  aminotransferase AlaT  35.43 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5156  aminotransferase AlaT  39.21 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.32187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1418  aminotransferase AlaT  38.56 
 
 		 412 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00886152  normal  0.0522162 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3862  aminotransferase AlaT  35.77 
 
 		 408 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.693995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1481  aminotransferase AlaT  37.13 
 
 		 403 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1793  aminotransferase AlaT  38.81 
 
 		 412 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1447  aminotransferase AlaT  37.13 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0541953  normal  0.418968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2327  aminotransferase AlaT  37.13 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218058  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  36.52 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27500  aminotransferase AlaT  36.88 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0223  normal  0.0677346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1872  aminotransferase AlaT  37.06 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.866522  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  36.55 
 
 		 413 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15420  aminotransferase AlaT  37.47 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3843  aminotransferase AlaT  37.22 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0237926  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1879  aminotransferase AlaT  38.56 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123534  hitchhiker  0.0000142896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  36.87 
 
 		 414 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6224  aminotransferase AlaT  38.56 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1855  aminotransferase AlaT  38.56 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  36.36 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0441  aminotransferase AlaT  38.52 
 
 		 428 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283674  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0451  aminotransferase AlaT  38.52 
 
 		 428 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.343085  normal  0.024281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07490  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.47 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1311  aminotransferase AlaT  37.06 
 
 		 508 aa  246  6e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2522  aminotransferase AlaT  37.41 
 
 		 403 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0098496  normal  0.421504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2189  aminotransferase AlaT  37 
 
 		 407 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3601  aminotransferase AlaT  36.41 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.16413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>