More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1653 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
466 aa  956    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  71.83 
 
 
466 aa  712    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  63.73 
 
 
465 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.81 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.3 
 
 
465 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  61.84 
 
 
435 aa  558  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  61.09 
 
 
471 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
465 aa  286  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
467 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.81 
 
 
1694 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
927 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
1276 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
4489 aa  159  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 
468 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 
543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.48 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
562 aa  147  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
467 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
466 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
4079 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
711 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
878 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.75 
 
 
725 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.75 
 
 
810 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.86 
 
 
730 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06745  TPR repeat protein  23.5 
 
 
463 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
685 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.36 
 
 
707 aa  126  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.65 
 
 
1007 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
681 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.34 
 
 
1979 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.88 
 
 
1138 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.91 
 
 
564 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
1094 aa  120  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.25 
 
 
620 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.13 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
732 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
1192 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  32.5 
 
 
573 aa  117  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
602 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
512 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
1049 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
740 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
761 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.19 
 
 
1737 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 
955 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.27 
 
 
764 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.53 
 
 
706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
3035 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.76 
 
 
745 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
1276 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.14 
 
 
576 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.39 
 
 
632 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 
804 aa  108  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.07 
 
 
784 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.45 
 
 
635 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
467 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
523 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 
1013 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
1827 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.57 
 
 
1067 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
391 aa  107  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.83 
 
 
1056 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 
1069 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
909 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 
833 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
596 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.76 
 
 
1676 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.9 
 
 
1022 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
615 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
1297 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.04 
 
 
622 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
627 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 
449 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0296562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.48 
 
 
818 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.83 
 
 
292 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.32 
 
 
816 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 
2240 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  34.22 
 
 
560 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 
362 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2590  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
464 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
662 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.27 
 
 
462 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
363 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
393 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
637 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  21.41 
 
 
634 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
687 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.14 
 
 
626 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 
988 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
296 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3560 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
714 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>