More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1599 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  41.2 
 
 		 853 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 853 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  72.28 
 
 		 878 aa  1274    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 		 858 aa  658    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.05 
 
 		 871 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 		 855 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  47.75 
 
 		 891 aa  738    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  46.42 
 
 		 863 aa  791    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 853 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 854 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 859 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 856 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  45.12 
 
 		 823 aa  665    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 		 872 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 883 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 868 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 		 856 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 		 882 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 851 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 853 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 853 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 		 859 aa  655    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 855 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 869 aa  713    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 855 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 872 aa  716    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 882 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 860 aa  646    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 		 855 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.29 
 
 		 900 aa  653    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 		 874 aa  647    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.69 
 
 		 854 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 		 854 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 881 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 854 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 853 aa  648    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 872 aa  648    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.88 
 
 		 870 aa  729    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  44.42 
 
 		 882 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 851 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  66.74 
 
 		 873 aa  1186    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 856 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 		 872 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 851 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 871 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 		 837 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.57 
 
 		 870 aa  716    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  67.82 
 
 		 872 aa  1192    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 856 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 855 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 		 863 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  66.86 
 
 		 871 aa  1179    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 		 882 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 874 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.72 
 
 		 870 aa  719    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.77 
 
 		 854 aa  641    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 		 856 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.46 
 
 		 896 aa  709    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 867 aa  682    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  45.64 
 
 		 855 aa  753    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  39.39 
 
 		 887 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  41.59 
 
 		 862 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 884 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 884 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 871 aa  655    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 858 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 		 862 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 887 aa  658    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  67.21 
 
 		 872 aa  1206    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 859 aa  666    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 856 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 875 aa  1800    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 855 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 882 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 861 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 853 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 853 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 872 aa  703    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  44.11 
 
 		 873 aa  697    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 		 932 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  46.03 
 
 		 856 aa  771    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 		 910 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.17 
 
 		 910 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 856 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 		 901 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.66 
 
 		 861 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 		 861 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 878 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 		 861 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.18 
 
 		 859 aa  671    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 856 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 853 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 853 aa  665    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.4 
 
 		 855 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 		 855 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 		 859 aa  674    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 851 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  42.2 
 
 		 858 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 857 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  45.01 
 
 		 889 aa  708    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>