98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1578 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0859  major facilitator superfamily MFS_1  81.13 
 
 		 438 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.221691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1578  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  870    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0877587 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1481  transporter, putative  62.09 
 
 		 441 aa  559  1e-158  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1867  major facilitator transporter  64.19 
 
 		 436 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1686  major facilitator superfamily MFS_1  64.02 
 
 		 454 aa  547  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000674894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0889  transporter, putative  63.26 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1094  major facilitator superfamily MFS_1  62.62 
 
 		 437 aa  542  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.929439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  34.25 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2239  ferric reductase domain-containing protein  25.06 
 
 		 642 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0544393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57608  predicted protein  25.64 
 
 		 474 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.371537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01489  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04850)  22.49 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0186505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  25.07 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 452 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  24.93 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  24.27 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  33.02 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  33.02 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  33.02 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  37.08 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  33.02 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  24.27 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  24.27 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  24.27 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0368  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  36.67 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  24.65 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  24.23 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 462 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  29.3 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 534 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.15 
 
 		 558 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 407 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2849  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  28.68 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  21.07 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  25 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  25 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  24.84 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19051  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  22.95 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.57 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.45 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  24.84 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1065 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  24.84 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  31.82 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  34.94 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 537 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 450 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  32.1 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 473 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 463 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  24.49 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 464 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 464 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0451  major facilitator superfamily transporter  22.67 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.82484e-20 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0388  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000620465 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0409  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000062799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0396  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.786385  decreased coverage  4.1004499999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0295  major facilitator superfamily transporter  28.83 
 
 		 396 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  32.22 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  27.94 
 
 		 464 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0391  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>