More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1565 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  68.46 
 
 
502 aa  707  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  63.76 
 
 
504 aa  644  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  100 
 
 
502 aa  998  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.01531e-09  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  63.73 
 
 
498 aa  633  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  64.9 
 
 
505 aa  626  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  62 
 
 
506 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  59.8 
 
 
499 aa  575  1e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  49.21 
 
 
511 aa  349  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  44.94 
 
 
457 aa  345  7e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  42.8 
 
 
471 aa  344  3e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  42.86 
 
 
511 aa  338  2e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  3.07319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.35 
 
 
472 aa  336  6e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  45.39 
 
 
458 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  44.54 
 
 
464 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  41.57 
 
 
473 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.81 
 
 
476 aa  333  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.81376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  41.63 
 
 
476 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  41.8 
 
 
476 aa  328  1e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.38 
 
 
479 aa  328  2e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.57 
 
 
476 aa  328  2e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.07 
 
 
474 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  42.6 
 
 
482 aa  323  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.29 
 
 
474 aa  322  1e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  41.72 
 
 
497 aa  320  4e-86  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.02 
 
 
479 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  43.24 
 
 
464 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.63 
 
 
476 aa  317  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  43.18 
 
 
481 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  43.36 
 
 
493 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  43.36 
 
 
506 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  39.72 
 
 
491 aa  316  6e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.98 
 
 
493 aa  315  1e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.28 
 
 
474 aa  315  1e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.17 
 
 
473 aa  315  2e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40 
 
 
469 aa  313  4e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.98 
 
 
492 aa  313  5e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.89 
 
 
464 aa  312  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.2 
 
 
477 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.76 
 
 
477 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.76 
 
 
480 aa  308  1e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.83 
 
 
513 aa  308  1e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.63 
 
 
477 aa  307  2e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  40.34 
 
 
498 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  40.34 
 
 
498 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  40.34 
 
 
498 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.4 
 
 
482 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  40.57 
 
 
501 aa  305  1e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  43.82 
 
 
461 aa  305  1e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  41.08 
 
 
466 aa  305  2e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.11 
 
 
474 aa  305  2e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  39.91 
 
 
481 aa  304  3e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.66 
 
 
481 aa  304  3e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.33 
 
 
478 aa  303  4e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  42 
 
 
475 aa  303  5e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  44.18 
 
 
473 aa  302  8e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.72 
 
 
485 aa  302  9e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.03 
 
 
475 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  40.22 
 
 
485 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  39.37 
 
 
473 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  40.48 
 
 
485 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  40.44 
 
 
490 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  39.75 
 
 
500 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  44.42 
 
 
462 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  39.43 
 
 
502 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  39.43 
 
 
502 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  39.43 
 
 
502 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.32 
 
 
478 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  39.43 
 
 
502 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.22 
 
 
479 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.88 
 
 
473 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  39.43 
 
 
461 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  39.43 
 
 
502 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  39.43 
 
 
485 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  41.14 
 
 
489 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  2.25032e-08  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  35.89 
 
 
503 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  39.39 
 
 
499 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  39.73 
 
 
505 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  41.61 
 
 
472 aa  294  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  48.28 
 
 
398 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  39.18 
 
 
499 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  38.99 
 
 
472 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  41.44 
 
 
500 aa  294  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  41.16 
 
 
490 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  40.71 
 
 
495 aa  293  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  43.79 
 
 
460 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  38.19 
 
 
514 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  38.7 
 
 
503 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  40.49 
 
 
495 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  40.51 
 
 
465 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  39.87 
 
 
487 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  40.49 
 
 
483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  40.49 
 
 
483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  40.49 
 
 
495 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  41.54 
 
 
507 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  40.49 
 
 
495 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  40.49 
 
 
495 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  40.49 
 
 
483 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.79 
 
 
467 aa  289  7e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  38.7 
 
 
503 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.13 
 
 
508 aa  289  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>