More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1564 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
160 aa  320  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  2.90434e-11  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  83.12 
 
 
160 aa  271  2e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  80 
 
 
159 aa  256  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  78.12 
 
 
160 aa  247  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  78.12 
 
 
159 aa  247  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  75.62 
 
 
159 aa  245  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  75.62 
 
 
176 aa  244  5e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 
158 aa  146  1e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  51.97 
 
 
157 aa  145  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 
159 aa  143  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 
160 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 
152 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 
164 aa  141  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 
162 aa  140  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.11465e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 
158 aa  139  2e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 
158 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 
158 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 
158 aa  138  4e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 
158 aa  138  4e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 
158 aa  138  4e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
158 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 
158 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 
158 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 
158 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  44.94 
 
 
158 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 
157 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 
157 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.58219e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 
159 aa  135  3e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 
158 aa  135  3e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
158 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
158 aa  134  7e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 
158 aa  133  1e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 
164 aa  133  1e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.4894e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 
176 aa  132  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 
158 aa  132  2e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.33551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 
158 aa  131  4e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.82345e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 
158 aa  131  4e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 
157 aa  130  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 
158 aa  130  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  4.26484e-12  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 
159 aa  130  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 
158 aa  130  7e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.87405e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
166 aa  130  7e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
166 aa  130  7e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 
158 aa  130  7e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 
166 aa  130  7e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 
158 aa  130  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 
173 aa  130  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  43.51 
 
 
158 aa  130  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 
158 aa  130  1e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 
158 aa  130  1e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 
158 aa  129  1e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 
157 aa  129  2e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 
158 aa  129  2e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  3.15443e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 
168 aa  129  2e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 
158 aa  129  2e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  41.77 
 
 
158 aa  129  2e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 
172 aa  128  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 
158 aa  129  2e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 
158 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 
159 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.08338e-13  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 
156 aa  128  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 
158 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 
158 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 
157 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 
168 aa  128  4e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 
158 aa  128  4e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.43014e-05  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 
158 aa  127  4e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 
158 aa  127  5e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  44.08 
 
 
157 aa  127  5e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 
153 aa  127  5e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 
158 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 
165 aa  127  7e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 
174 aa  127  7e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 
161 aa  127  8e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.78945e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 
158 aa  127  8e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 
158 aa  126  1e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 
158 aa  126  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 
157 aa  126  1e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 
158 aa  126  1e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 
158 aa  125  2e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 
158 aa  125  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 
152 aa  125  2e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 
158 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 
169 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 
158 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 
158 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 
158 aa  125  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.49804e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 
158 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 
158 aa  124  4e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.72965e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 
158 aa  124  4e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 
158 aa  124  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 
158 aa  124  4e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.2178e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>