More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1544 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
155 aa  324  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.68 
 
 
163 aa  165  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.42 
 
 
155 aa  164  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  49.33 
 
 
157 aa  164  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.98 
 
 
161 aa  164  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  50 
 
 
163 aa  163  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.03 
 
 
158 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.94 
 
 
158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
160 aa  160  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  49.33 
 
 
150 aa  156  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.32 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.68 
 
 
158 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  45.45 
 
 
159 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  45.45 
 
 
159 aa  148  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  45.03 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  46.1 
 
 
186 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.09 
 
 
157 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.65 
 
 
223 aa  139  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.31 
 
 
164 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  44.94 
 
 
149 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.21 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.58 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  49.23 
 
 
161 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.94 
 
 
164 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  44.83 
 
 
156 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1141  guanine deaminase  50.68 
 
 
158 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172316  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.86 
 
 
160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.72 
 
 
159 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  41.61 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.34 
 
 
161 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  38.1 
 
 
151 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  37.41 
 
 
151 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.75 
 
 
157 aa  120  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3292  Guanine deaminase  36.87 
 
 
188 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.650383  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.29 
 
 
161 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  42.76 
 
 
158 aa  116  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.67 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.79 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.26 
 
 
153 aa  114  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.97 
 
 
153 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  45.24 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.61 
 
 
163 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.55 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.67 
 
 
152 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.52 
 
 
190 aa  110  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.25 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.22 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.22 
 
 
152 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  47.37 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.18 
 
 
214 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  36.6 
 
 
154 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  36.6 
 
 
154 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1066  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.64 
 
 
188 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  37.18 
 
 
176 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1303  cytosine/adenosine deaminase  40.14 
 
 
148 aa  103  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 
161 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.53 
 
 
162 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.47 
 
 
153 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2814  cytidine/deoxycytidylate deaminase  40.3 
 
 
155 aa  101  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.02 
 
 
174 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  48.57 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  41.13 
 
 
157 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3440  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.4 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.41 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.28 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.51 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  41.38 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2500  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.27 
 
 
190 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.59246 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  42.86 
 
 
182 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.12 
 
 
153 aa  94  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.6 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.54 
 
 
148 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.96 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0141  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.8 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  43.8 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.23 
 
 
143 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.68 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  40.74 
 
 
193 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.53 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.28 
 
 
461 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.67 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4858  cytidine/deoxycytidylate deaminase  33.11 
 
 
167 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0037  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.27 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1700  tRNA-adenosine deaminase  42.57 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448042  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.86 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2498  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.23 
 
 
197 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.63 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.57 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  42.31 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  45.36 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.61 
 
 
164 aa  87.8  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.98 
 
 
361 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.93 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0223  tRNA-adenosine deaminase  44.25 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.98 
 
 
361 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4326  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2436  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.25 
 
 
301 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>