More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1495 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  62.57 
 
 
265 aa  255  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  63.69 
 
 
186 aa  253  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  62.43 
 
 
192 aa  253  9e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  63.89 
 
 
177 aa  246  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  55 
 
 
188 aa  213  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
188 aa  143  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
188 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  37.85 
 
 
190 aa  124  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
183 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
186 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  42 
 
 
187 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  30 
 
 
196 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
184 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
191 aa  97.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  29.21 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
179 aa  87  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
166 aa  87  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
210 aa  84.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
184 aa  82  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  30 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  31.1 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  26.4 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  30.77 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  32.12 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  29.88 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  30.18 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  32.64 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  27.16 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  31.98 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  25.73 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  31.1 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  30 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  27.27 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  27.95 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  27.91 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  27.81 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  26.47 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  26.47 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  29.59 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  26.32 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>