More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1469 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  82.18 
 
 
608 aa  1060    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
604 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 
599 aa  683    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 
600 aa  661    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 
604 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
607 aa  674    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 
590 aa  679    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 
604 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  75.71 
 
 
604 aa  986    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  77.34 
 
 
605 aa  980    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
608 aa  1253    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  80.81 
 
 
605 aa  1023    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 
606 aa  693    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
590 aa  679    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
590 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
590 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
590 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
595 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 
619 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
605 aa  646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  77.96 
 
 
601 aa  1004    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
593 aa  707    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
614 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
625 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 
604 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
591 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  76.77 
 
 
606 aa  1006    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 
597 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
590 aa  631  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 
590 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
588 aa  632  1e-180  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
590 aa  633  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
596 aa  629  1e-179  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
595 aa  630  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 
595 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 
590 aa  625  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 
595 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
594 aa  625  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
591 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
595 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
593 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
594 aa  618  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
591 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
591 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 
591 aa  614  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
591 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
609 aa  610  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
623 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
596 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
623 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
601 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 
600 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
581 aa  579  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
597 aa  550  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
592 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
592 aa  546  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
603 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
597 aa  534  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
590 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
588 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
589 aa  525  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
598 aa  518  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
594 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
594 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
583 aa  521  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
600 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
598 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
586 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
590 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
600 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
608 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2475  aspartyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
595 aa  517  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1213  aspartyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
591 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352456  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
591 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
599 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
591 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
598 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
589 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
591 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
602 aa  513  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
591 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
591 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
598 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
591 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
591 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
591 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
583 aa  511  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
591 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
591 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
591 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 
594 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
589 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
600 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
594 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
591 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
591 aa  511  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 
595 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
583 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>