More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1460 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  65.53 
 
 		 217 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  63.64 
 
 		 214 aa  270  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  61.03 
 
 		 219 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  60.29 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  61.11 
 
 		 217 aa  257  9e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  54.98 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.39 
 
 		 203 aa  191  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  44.61 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.72 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.78 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  47.4 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  43.46 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  45.45 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  42.11 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  43.54 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.5 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  41.43 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  40.54 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  45.32 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.89 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  42.59 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  42.23 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  43.81 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.33 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  43.52 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  41.75 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  43.06 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.78 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.1 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  40.85 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  47.4 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  37.68 
 
 		 209 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  43.78 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 688 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  43.2 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  40.64 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  38.86 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  41.06 
 
 		 209 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  41.95 
 
 		 197 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  40.95 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  39.41 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  42.99 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  38.57 
 
 		 204 aa  151  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  37.38 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  39.71 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  38.14 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.43 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  42.06 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  39.64 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  44.56 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  39.9 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  40.67 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  40.09 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  39.25 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  40.53 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  41.92 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  39.04 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0780  thymidylate kinase  41.12 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  40.39 
 
 		 671 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  39.8 
 
 		 901 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  39.13 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  37.44 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.57 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40.58 
 
 		 686 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  43.15 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  37.62 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  37.09 
 
 		 210 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  41.05 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  39.23 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  38.74 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  41.18 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  38.29 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  40.61 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1251  thymidylate kinase  40 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  40.91 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  43.23 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  39.05 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  39.27 
 
 		 226 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  36.19 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  43.23 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  38.07 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>