171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1456 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 
184 aa  384  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  53.15 
 
 
161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  46.1 
 
 
238 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  36.76 
 
 
232 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  37.93 
 
 
221 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  37.36 
 
 
221 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  35.52 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.96 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  32.52 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  37.6 
 
 
153 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  37.69 
 
 
148 aa  99  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  35.38 
 
 
153 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  36.08 
 
 
227 aa  97.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  34.62 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  35.51 
 
 
216 aa  95.9  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  33.59 
 
 
156 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  38.58 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  35.97 
 
 
196 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.71 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  35.43 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  32.24 
 
 
225 aa  89  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  40.43 
 
 
171 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.03 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  34.33 
 
 
191 aa  87.8  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  34.07 
 
 
205 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.1 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.37 
 
 
175 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.03 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  35.94 
 
 
150 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.91 
 
 
171 aa  85.5  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  34.92 
 
 
228 aa  85.5  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.17 
 
 
164 aa  85.5  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.61 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  30.57 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  35.57 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.21 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.04 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  29.66 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  26.63 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  32 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  32.56 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.91 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  34.81 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  32.56 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  26.67 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.76 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  25.99 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  28.37 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  30.07 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.87 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  28.93 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  32.35 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30.5 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  28.67 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  32.56 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  31.03 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  26.84 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  33.81 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  33.81 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.61 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2368  nuclease (SNase domain protein)  50.94 
 
 
122 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  30.57 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  36.84 
 
 
286 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  27.96 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  34.88 
 
 
257 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  30.3 
 
 
200 aa  61.6  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  33.6 
 
 
136 aa  62  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  26.95 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  30.25 
 
 
266 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  27.92 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.71 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  26.67 
 
 
214 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  26.47 
 
 
214 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  26.47 
 
 
214 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  28.89 
 
 
169 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.69 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.69 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  25.54 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  31.06 
 
 
266 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  27.41 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  28.75 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  30.47 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  32.35 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  30.06 
 
 
273 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  28.76 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  26.32 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  31.54 
 
 
224 aa  55.1  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  27.15 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  31.91 
 
 
278 aa  54.7  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  28.57 
 
 
267 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  30.94 
 
 
190 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  28.36 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  32.69 
 
 
323 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  24.84 
 
 
271 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>