130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1431 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1431  phosphoribulokinase/uridine kinase  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0173  uridine kinase-like protein  77.17 
 
 		 219 aa  346  2e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  63.43 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.87 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0659  phosphoribulokinase/uridine kinase  55.09 
 
 		 237 aa  246  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0052  uridine kinase-like  57.71 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  26.7 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  26.7 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  24.08 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  28.38 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  26.9 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  25.19 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  27.16 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1154  hypothetical protein  24.14 
 
 		 313 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.332851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  26.82 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  26.62 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  22.14 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4133  pantothenate kinase  29.08 
 
 		 312 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4208  pantothenate kinase  29.08 
 
 		 312 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1934  phosphoribulokinase/uridine kinase  28.78 
 
 		 340 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0863853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4364  pantothenate kinase  29.08 
 
 		 312 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  26.18 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4705  pantothenate kinase  25.77 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000664944  hitchhiker  0.000162185 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  29.85 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  24.76 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  24.76 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3627  phosphoribulokinase/uridine kinase  35.14 
 
 		 290 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.694975  normal  0.715068 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  23.66 
 
 		 504 aa  48.5  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1661  pantothenate kinase  29.5 
 
 		 313 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  31.4 
 
 		 363 aa  48.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1864  phosphoribulokinase  28.19 
 
 		 300 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.712466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4658  pantothenate kinase  29.08 
 
 		 312 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  30 
 
 		 363 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  41.38 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  23.08 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000175656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3754  phosphoribulokinase  27.08 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  24.32 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0371  putative fructose transport system kinase  36.36 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2058  pantothenate kinase  27.66 
 
 		 312 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0682645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5982  MRP protein-like protein  41.94 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141343  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  30.4 
 
 		 362 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  29.23 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3100  pantothenate kinase  30.58 
 
 		 345 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  28.65 
 
 		 310 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0986  putative fructose transport system kinase  26.38 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1512  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.69 
 
 		 294 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000087167  decreased coverage  0.0000773868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1848  uridine kinase  23.66 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11113  pantothenate kinase  26.95 
 
 		 312 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4585e-60  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2647  putative fructose transport system kinase  26.38 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0156  pantothenate kinase  29.45 
 
 		 314 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1447  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.67 
 
 		 325 aa  45.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  30.07 
 
 		 318 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0184  pantothenate kinase  27.81 
 
 		 316 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000868575  normal  0.167512 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  42.37 
 
 		 311 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0622  pantothenate kinase  28 
 
 		 324 aa  45.1  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0185  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 316 aa  45.1  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128466  hitchhiker  0.000667129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.16 
 
 		 553 aa  45.1  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  30.65 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  25.9 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  32.77 
 
 		 374 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0183  pantothenate kinase  27.89 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000066395  normal  0.0569679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0178  pantothenate kinase  27.89 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0139857  normal  0.0123189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0198  pantothenate kinase  28.86 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000383572  hitchhiker  0.000766195 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4173  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000219645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  25.16 
 
 		 552 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0143  pantothenate kinase  28.1 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000477456  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3132  pantothenate kinase  27.86 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1619  pantothenate kinase  27.27 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0181  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000275629  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0129  putative fructose transport system kinase  38.89 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5025  Mrp protein  41.27 
 
 		 375 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4565  MRP protein-like protein  41.27 
 
 		 378 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  43.64 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  27.13 
 
 		 318 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  30.4 
 
 		 373 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0982  pantothenate kinase  25 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  0.0147256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4071  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.031551  normal  0.150968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  35.53 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0133  pantothenate kinase  30.43 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000279273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1263  pantothenate kinase  26.35 
 
 		 314 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3049  Mrp protein  30.08 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.753797  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0442  hypothetical protein  39.68 
 
 		 384 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.0224463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0169  pantothenate kinase  27.59 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325542  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5952  phosphoribulokinase  30.14 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0178204 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0678  ATPase-like, ParA/MinD  28.8 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  25.34 
 
 		 390 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0789  phosphoribulokinase  27.52 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0104023  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1927  MRP protein-like  32.88 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2404  phosphoribulokinase  24.67 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154071  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0196  pantothenate kinase  26.97 
 
 		 317 aa  43.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000216211  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 312 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0237  putative fructose transport system kinase  25.31 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3774  pantothenate kinase  28.29 
 
 		 316 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000324859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.38 
 
 		 555 aa  43.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  24.38 
 
 		 555 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6493  phosphoribulokinase  32.43 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0819827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5598  histidinol-phosphate phosphatase family protein  29.14 
 
 		 649 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  27.54 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>