More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1429 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  245  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 231 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.7 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.44 
 
 		 310 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  43.44 
 
 		 457 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 238 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 1002 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  45.9 
 
 		 235 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  47.5 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.63 
 
 		 326 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  43.9 
 
 		 242 aa  100  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.38 
 
 		 229 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 225 aa  100  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.32 
 
 		 371 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 225 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 236 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  43.7 
 
 		 455 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1054  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 359 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 230 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 259 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0747  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 247 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 229 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.16 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.8 
 
 		 230 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.8 
 
 		 237 aa  99  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  45.3 
 
 		 248 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4400  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 236 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  43.8 
 
 		 326 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2689  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  44.54 
 
 		 229 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000627834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  43.55 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 225 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 243 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  43.7 
 
 		 457 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 242 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 224 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 232 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 231 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 231 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0720  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 236 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 244 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  42.74 
 
 		 229 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1438  putative PAS/PAC sensor protein  46.96 
 
 		 393 aa  97.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  44.44 
 
 		 248 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 235 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 243 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  45.3 
 
 		 248 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 216 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 216 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  42.74 
 
 		 1334 aa  97.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 233 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 229 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.69 
 
 		 231 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  42.86 
 
 		 457 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  97.1  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  41.8 
 
 		 230 aa  96.7  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  44.54 
 
 		 239 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  45.08 
 
 		 225 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 229 aa  95.9  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 239 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 241 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.88 
 
 		 233 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 239 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.54 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 229 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 229 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.7 
 
 		 457 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 457 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 806 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  43.09 
 
 		 352 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  39.17 
 
 		 1347 aa  95.5  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.5 
 
 		 236 aa  95.1  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  42.5 
 
 		 457 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.83 
 
 		 239 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 227 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 243 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 237 aa  94.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  42.74 
 
 		 355 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 243 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>