More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1407 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 398 aa  814    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  65.24 
 
 		 398 aa  532  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  33.15 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  35.31 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  33.66 
 
 		 409 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  29.62 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  31.49 
 
 		 403 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  30.91 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.95 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  31.03 
 
 		 434 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  31.09 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.26 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  35.37 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  33.12 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  36.01 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  29.38 
 
 		 426 aa  126  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.15 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  31.01 
 
 		 443 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  32.79 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  30.98 
 
 		 420 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  30.2 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  30.69 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  29.64 
 
 		 395 aa  120  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  32.97 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  31.74 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.01 
 
 		 378 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 457 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  30.51 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  32.03 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  31.74 
 
 		 435 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  31.17 
 
 		 387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  30.68 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  31.5 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  32.65 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  32.68 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 		 385 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  32.62 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  30.52 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  30.7 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  28.03 
 
 		 431 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  29.63 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  30.56 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  30.56 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  30.56 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  29.9 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  26.63 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  30.54 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  27.46 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  30.31 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  29.88 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.29 
 
 		 407 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.85 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.99 
 
 		 406 aa  97.1  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  25.97 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 413 aa  93.6  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  30.87 
 
 		 418 aa  94  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.11 
 
 		 455 aa  93.2  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 416 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 379 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.83 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.19 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 380 aa  90.1  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>