More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1393 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
148 aa  309  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  62.68 
 
 
145 aa  203  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  58.04 
 
 
151 aa  188  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  57.04 
 
 
144 aa  181  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  55.71 
 
 
144 aa  174  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  52.78 
 
 
150 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  49.65 
 
 
150 aa  148  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.55 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  49.28 
 
 
139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  44.22 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  45.52 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  46.38 
 
 
142 aa  124  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.57 
 
 
138 aa  120  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.93 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.65 
 
 
143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  44.06 
 
 
142 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.27 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.7 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  45.21 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.01 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  44.14 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  40.69 
 
 
141 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
143 aa  107  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  39.16 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.57 
 
 
143 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  41.38 
 
 
138 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  43.51 
 
 
140 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  40.74 
 
 
144 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  42.25 
 
 
164 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
143 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 
140 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  43.33 
 
 
258 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  42.45 
 
 
139 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.44 
 
 
157 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  43.8 
 
 
148 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
258 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.69 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.96 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  39.58 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  45.19 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  40.27 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  39.29 
 
 
175 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  41.04 
 
 
254 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
269 aa  93.6  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  38.03 
 
 
145 aa  93.2  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0366  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.62 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.6 
 
 
299 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  36.5 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.13 
 
 
137 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  41.6 
 
 
127 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0634  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.62 
 
 
453 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37234  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  38.81 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5094  protein tyrosine phosphatase  38.19 
 
 
225 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.13 
 
 
137 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  41.35 
 
 
254 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0820  protein tyrosine phosphatase  40.29 
 
 
150 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.580395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4498  arsenate reductase (ArsC)  39.44 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.898204  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
275 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12661  arsenic-transport integral membrane protein arsC  38.36 
 
 
498 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000400645  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  39.01 
 
 
299 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5424  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.51 
 
 
137 aa  91.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.570672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 
171 aa  90.5  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4720  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.58 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.673228  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0791  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.01 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0213  protein tyrosine phosphatase  38.19 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.14 
 
 
175 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4499  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.41 
 
 
139 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  37.84 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  39.55 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0566  protein tyrosine phosphatase  38.62 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3468  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  32.65 
 
 
173 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
255 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14650  protein-tyrosine-phosphatase  40.74 
 
 
147 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.5 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.5 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  35.46 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.35 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2325  protein tyrosine phosphatase  37.24 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.752369  normal  0.361606 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0575  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  35.71 
 
 
287 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14670  protein tyrosine phosphatase  40.54 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000136299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4904  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
217 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  37.59 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.94 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4521  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
217 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4608  protein tyrosine phosphatase  38.46 
 
 
217 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8606  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.73 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  0.381318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0106  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.03 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>