32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1377 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
325 aa  672    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.45 
 
 
341 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.39 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.57 
 
 
342 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  46.82 
 
 
348 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.69 
 
 
347 aa  279  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  41.53 
 
 
331 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  32.59 
 
 
324 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  32.62 
 
 
342 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.23 
 
 
348 aa  155  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  28.91 
 
 
363 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  31.21 
 
 
359 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  32.1 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.55 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.46 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.61 
 
 
499 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.41 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.56 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 
460 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.2 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  31.16 
 
 
802 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.99 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0526  hypothetical protein  27.81 
 
 
209 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.39 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.29 
 
 
821 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.43 
 
 
375 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
647 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>