237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1356 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1524  alpha-amylase family protein  57.75 
 
 		 636 aa  764    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0281474  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1176  alpha-amylase family protein  56.58 
 
 		 634 aa  750    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.470418  normal  0.104787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1381  alpha-amylase family protein  56.12 
 
 		 661 aa  756    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1085  alpha-amylase family protein  58.22 
 
 		 649 aa  783    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151666  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0963  alpha-amylase family protein  58.93 
 
 		 638 aa  785    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1122  alpha-amylase family protein  60.06 
 
 		 629 aa  802    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110561  normal  0.457089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1356  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 642 aa  1332    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000107731  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0458  alpha amylase, catalytic region  33.56 
 
 		 663 aa  281  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0143  alpha amylase catalytic sub domain protein  31.69 
 
 		 692 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0052779  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1144  alpha amylase catalytic region  29.32 
 
 		 669 aa  251  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00833327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0159  hypothetical protein  30.05 
 
 		 637 aa  240  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00185609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0161  alpha amylase, catalytic region  30.05 
 
 		 637 aa  240  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00960046  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0463  alpha amylase domain-containing protein  29.52 
 
 		 676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.694726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09700  alpha amylase  31.94 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2732  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.839185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2541  alpha amylase catalytic region  29.87 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0134925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1179  alpha amylase catalytic region  36.45 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1210  alpha amylase, catalytic region  30.19 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2810  alpha amylase, catalytic region  35.19 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1141  alpha amylase, catalytic region  36.84 
 
 		 422 aa  72  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1813  alpha amylase catalytic region  28.48 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01125  alpha-amylase, putative  28.67 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6320  alpha amylase catalytic region  28.93 
 
 		 1133 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330794  normal  0.20234 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1713  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746329  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5590  alpha amylase, catalytic region  29.26 
 
 		 1136 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0869  alpha amylase catalytic region  27.5 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1097  alpha amylase catalytic region  36.3 
 
 		 716 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.992454  hitchhiker  0.0010737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  26.35 
 
 		 654 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  27.49 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1330  alpha amylase, catalytic region  27.41 
 
 		 1130 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460745  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6088  alpha amylase catalytic region  27.41 
 
 		 1130 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6499  alpha amylase, catalytic region  27.41 
 
 		 1130 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.145776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7034  Alpha amylase like protein  30.08 
 
 		 1130 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.673665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4100  alpha amylase catalytic region  27.51 
 
 		 687 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2445  putative Alpha amylase  30.88 
 
 		 734 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1956  alpha amylase catalytic region  30.57 
 
 		 666 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  28.27 
 
 		 1122 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0034  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 		 663 aa  56.2  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5491  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 1131 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1109  alpha amylase, catalytic region  30.88 
 
 		 715 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1738  alpha amylase domain-containing protein  27.75 
 
 		 1148 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0135  alpha amylase catalytic region  26.77 
 
 		 660 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 483 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1545  alpha amylase family protein  27.75 
 
 		 1115 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0622  alpha amylase family protein  27.75 
 
 		 1115 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1783  alpha amylase, catalytic region  32.18 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00829372  normal  0.075062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0116  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 660 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  30.08 
 
 		 1126 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2030  alpha amylase domain-containing protein  32.41 
 
 		 672 aa  55.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.219861  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1341  alpha amylase family protein  27.75 
 
 		 1136 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0533  alpha amylase family protein  27.75 
 
 		 1115 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1568  glycosy hydrolase family protein  27.75 
 
 		 1115 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4060  alpha-amylase family protein  31.61 
 
 		 661 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203382  normal  0.586391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 1122 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1337  alpha amylase catalytic region  32.41 
 
 		 678 aa  54.7  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  31.97 
 
 		 1048 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1984  alpha amylase domain-containing protein  32.33 
 
 		 671 aa  54.3  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.13 
 
 		 560 aa  53.9  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0829  Alpha amylase, catalytic region  24.67 
 
 		 662 aa  53.9  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.673433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 1124 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3583  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 684 aa  53.9  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1604  Alpha amylase, catalytic region  35.09 
 
 		 688 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3112  alpha amylase protein  25.28 
 
 		 535 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.364914  normal  0.605124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1076  alpha amylase domain-containing protein  31.48 
 
 		 685 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.819574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4393  alpha amylase catalytic region  22.82 
 
 		 1144 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.573517  normal  0.10506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 1124 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2783  alpha amylase catalytic region  33.1 
 
 		 670 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  26.03 
 
 		 1124 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11359  glucanase glgE  30 
 
 		 701 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.759121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2417  alpha amylase catalytic region  30.34 
 
 		 816 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00733114  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2679  alpha amylase, catalytic region  30.83 
 
 		 671 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3102  alpha amylase catalytic region  26.94 
 
 		 548 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355967  normal  0.289712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1649  alpha-glucosidase  24.84 
 
 		 552 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.856905  hitchhiker  0.000000195123 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1190  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.76 
 
 		 746 aa  52.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2858  alpha amylase catalytic region  29.45 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0540  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 		 1037 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1279  alpha amylase catalytic region  29.66 
 
 		 666 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0559691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2833  alpha amylase catalytic region  25.91 
 
 		 548 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.518671  normal  0.538121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  32.84 
 
 		 481 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3176  alpha amylase catalytic region  25.97 
 
 		 682 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000122162  hitchhiker  0.0000126185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  30.43 
 
 		 484 aa  52  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4163  alpha amylase catalytic region  30.83 
 
 		 651 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5565  alpha-amylase-related protein  27.08 
 
 		 1082 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6821  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 1151 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137668  normal  0.518409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10340  glycosidase  32.23 
 
 		 663 aa  51.6  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09540  glycosidase  31.03 
 
 		 715 aa  51.6  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0200177  normal  0.351025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0331  alpha amylase catalytic region  30.07 
 
 		 652 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  24.85 
 
 		 560 aa  51.6  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1017  alpha amylase catalytic region  27.91 
 
 		 544 aa  51.2  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.503917 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2088  alpha amylase catalytic region  25.54 
 
 		 541 aa  51.2  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  29.2 
 
 		 562 aa  51.2  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 481 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0138  alpha amylase, catalytic region  30.14 
 
 		 732 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3659  alpha amylase catalytic region  31.03 
 
 		 672 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0914458  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2861  putative alpha-amylase-related protein  27.45 
 
 		 1146 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2489  Alpha amylase, catalytic region  26.77 
 
 		 672 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3300  alpha-glucosidase  24.46 
 
 		 555 aa  50.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2089  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 		 679 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  26.75 
 
 		 481 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2934  alpha amylase, catalytic region  26.2 
 
 		 1022 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>