128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1346 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  100 
 
 
198 aa  384  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  1.05881e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  69.39 
 
 
198 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  45.92 
 
 
197 aa  182  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  9.20884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  50.51 
 
 
204 aa  181  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  41.92 
 
 
208 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  46.43 
 
 
208 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  45.92 
 
 
204 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.65772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  40.5 
 
 
203 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  43.15 
 
 
211 aa  154  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  42.05 
 
 
430 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  44.9 
 
 
201 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  44.9 
 
 
211 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.97 
 
 
204 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  39.49 
 
 
211 aa  139  2e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  39.49 
 
 
211 aa  139  2e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  49.49 
 
 
204 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  41.21 
 
 
205 aa  134  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  41.62 
 
 
193 aa  130  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  43.88 
 
 
194 aa  121  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  41.41 
 
 
195 aa  119  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  43.84 
 
 
207 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  41.21 
 
 
205 aa  114  8e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  36.14 
 
 
201 aa  114  8e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  37.74 
 
 
214 aa  95.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  36.6 
 
 
197 aa  82.8  3e-15  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  33.64 
 
 
245 aa  70.1  2e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.72 
 
 
204 aa  70.1  2e-11  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  30.05 
 
 
251 aa  68.6  7e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  32.74 
 
 
256 aa  65.5  4e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  30.05 
 
 
321 aa  65.1  6e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  33.18 
 
 
231 aa  64.7  8e-10  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.77 
 
 
213 aa  63.9  2e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0090  cobalt transport protein CbiM  27.8 
 
 
210 aa  63.5  2e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.03 
 
 
299 aa  62  6e-09  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  33.18 
 
 
225 aa  61.6  6e-09  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.43 
 
 
202 aa  61.6  7e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  31.84 
 
 
231 aa  61.2  9e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  32.09 
 
 
225 aa  61.2  1e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  33.65 
 
 
225 aa  60.8  1e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  33.18 
 
 
225 aa  60.5  2e-08  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.1 
 
 
246 aa  59.7  3e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.3 
 
 
216 aa  58.9  5e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  30.14 
 
 
225 aa  58.2  7e-08  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1780  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.75 
 
 
307 aa  57.8  9e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.09 
 
 
333 aa  57.8  9e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  29.72 
 
 
246 aa  57  2e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.21341e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1148  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.74 
 
 
218 aa  55.5  5e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00870535  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1927  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  39.13 
 
 
242 aa  55.5  6e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.55 
 
 
236 aa  53.5  2e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1569  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.38 
 
 
233 aa  52.8  3e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.5 
 
 
310 aa  52.8  3e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.7 
 
 
213 aa  52.8  4e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  24.64 
 
 
212 aa  52.4  4e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  27.27 
 
 
231 aa  52  5e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.1 
 
 
235 aa  52.4  5e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.91 
 
 
241 aa  51.6  7e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  26.89 
 
 
235 aa  51.6  7e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.63 
 
 
232 aa  51.6  7e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.91 
 
 
241 aa  51.6  7e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1697  cobalt transport protein CbiM  34.5 
 
 
225 aa  50.8  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.30926 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0146  cobalt transport protein CbiM  31.35 
 
 
221 aa  50.1  2e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0185688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  32.56 
 
 
249 aa  50.4  2e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.36 
 
 
202 aa  50.1  2e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1929  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  28.93 
 
 
259 aa  50.4  2e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88224  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2134  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.03 
 
 
261 aa  50.4  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.66 
 
 
250 aa  49.3  3e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.82 
 
 
246 aa  49.3  3e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.73 
 
 
232 aa  49.7  3e-05  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  32.17 
 
 
226 aa  49.3  3e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1755  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.95 
 
 
306 aa  49.7  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379762  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0927  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.05 
 
 
250 aa  48.9  4e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.326506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  30.81 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  30.81 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  30.81 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  30.81 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  29.15 
 
 
247 aa  48.9  5e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  30.81 
 
 
245 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  31.06 
 
 
230 aa  48.9  5e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  34.78 
 
 
235 aa  48.5  7e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.96 
 
 
326 aa  48.5  7e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.801433  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.98 
 
 
354 aa  48.5  7e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  37.97 
 
 
217 aa  48.1  9e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4360  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.18 
 
 
328 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.04 
 
 
241 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.02 
 
 
355 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38373e-24 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.19 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2109  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.97 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494306  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2046  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.97 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  31.02 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  31.02 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2063  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  36.97 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  30.81 
 
 
225 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2762  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.37 
 
 
348 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.79 
 
 
248 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.14 
 
 
421 aa  45.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3589  cobalamin biosynthesis protein CbiM  27.78 
 
 
232 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.91 
 
 
235 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1637  cobalt transport protein CbiM  24.79 
 
 
242 aa  45.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000771093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  23.74 
 
 
352 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>