29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1345 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1345  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  594  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.31806e-07  unclonable  1.25757e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1134  hypothetical protein  62.92 
 
 
267 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2023  hypothetical protein  52.92 
 
 
257 aa  289  5e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.1532e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3139  hypothetical protein  52.17 
 
 
256 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1470  hypothetical protein  52.74 
 
 
256 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.225358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0755  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  50.59 
 
 
256 aa  260  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.824327 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3109  hypothetical protein  49.01 
 
 
256 aa  255  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  5.3036e-08  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1189  hypothetical protein  48.44 
 
 
272 aa  253  2e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  9.03745e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0558  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  47.2 
 
 
248 aa  245  6e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1952  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  45.61 
 
 
274 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21038  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3501  putative lipoprotein  47.67 
 
 
265 aa  234  1e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0170  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  45.35 
 
 
251 aa  234  2e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2859  hypothetical protein  45.72 
 
 
262 aa  228  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0540  hypothetical protein  49.38 
 
 
260 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0545  ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  43.63 
 
 
252 aa  225  8e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1364  putative lipoprotein  45.56 
 
 
252 aa  221  1e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1320  putative lipoprotein  45.56 
 
 
252 aa  221  1e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3946  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  46.86 
 
 
256 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6168  ABC cobalt transporter periplasmic binding protein CbiN  46.03 
 
 
256 aa  216  3e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1551  Nickel transport complex, NikM subunit, transmembrane  36.96 
 
 
273 aa  166  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0798681  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3437  hypothetical protein  38.25 
 
 
248 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1958  hypothetical protein  38.74 
 
 
264 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3141  hypothetical protein  38.13 
 
 
266 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.39033e-05  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0648  hypothetical protein  35.48 
 
 
274 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2092  ABC cobalt transporter, periplasmic binding protein CbiN  33.21 
 
 
256 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0064068  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1734  hypothetical protein  32.14 
 
 
379 aa  127  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00120517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2058  hypothetical protein  34.6 
 
 
272 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00309016  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2061  hypothetical protein  29.64 
 
 
337 aa  99  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00336712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0140  hypothetical protein  29.73 
 
 
269 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.621783  normal  0.143502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>