More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1342 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  227  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  3.01067e-09  unclonable  1.08063e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  92.04 
 
 
113 aa  214  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  84.07 
 
 
113 aa  200  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.23389e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  80.53 
 
 
113 aa  197  4e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  1.55222e-06  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  65.49 
 
 
113 aa  150  6e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.64694e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  65.49 
 
 
113 aa  150  6e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0112  nitrogen regulatory protein P-II  56.64 
 
 
113 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3050  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 
113 aa  125  2e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.59817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  117  4e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68327e-06 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  116  8e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  117  8e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  116  8e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  116  1e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  116  1e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  2e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  2e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  2e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  2e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  115  2e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  115  2e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  115  2e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  52.68 
 
 
112 aa  115  2e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  57.14 
 
 
112 aa  115  2e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  115  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
121 aa  114  4e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.14835e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
113 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  51.79 
 
 
112 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.37232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  52.68 
 
 
112 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 
112 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  114  7e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  113  7e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  8e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  113  8e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  1e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  113  1e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  113  1e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  113  1e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  113  1e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  112  2e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  112  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  112  2e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  112  2e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  53.57 
 
 
114 aa  112  2e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  112  2e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
114 aa  112  2e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  112  2e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 
112 aa  112  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  50.89 
 
 
116 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 
112 aa  111  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  111  4e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0159  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
114 aa  111  4e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  111  4e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.56099e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  111  4e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  111  4e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  111  4e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  7e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  50 
 
 
112 aa  110  7e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  7e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  7e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  7e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>