More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1339 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
548 aa  1136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  1.58602e-06 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  70.53 
 
 
562 aa  814  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  56.52 
 
 
554 aa  646  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  61.45 
 
 
531 aa  686  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  54.23 
 
 
545 aa  637  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  56.99 
 
 
545 aa  650  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  59.85 
 
 
548 aa  687  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5504  glucose-6-phosphate isomerase  61.51 
 
 
549 aa  698  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  59.44 
 
 
550 aa  669  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  64.78 
 
 
548 aa  745  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  59.85 
 
 
548 aa  686  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0373  glucose-6-phosphate isomerase  61.51 
 
 
549 aa  692  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03857  hypothetical protein  61.51 
 
 
549 aa  698  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0463  glucose-6-phosphate isomerase  60.77 
 
 
550 aa  677  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4264  glucose-6-phosphate isomerase  61.69 
 
 
549 aa  701  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  56.99 
 
 
545 aa  651  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2947  glucose-6-phosphate isomerase  64.03 
 
 
547 aa  687  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4573  glucose-6-phosphate isomerase  61.69 
 
 
549 aa  701  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  56.99 
 
 
545 aa  650  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0012  glucose-6-phosphate isomerase  57.59 
 
 
553 aa  657  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.350529  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4615  glucose-6-phosphate isomerase  60.22 
 
 
549 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267215 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  72.34 
 
 
559 aa  832  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  2.44755e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4563  glucose-6-phosphate isomerase  60.22 
 
 
549 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.963608  normal  0.872816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  58.52 
 
 
550 aa  661  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4563  glucose-6-phosphate isomerase  60.04 
 
 
549 aa  690  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  0.0348478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  62.18 
 
 
550 aa  698  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  62.36 
 
 
547 aa  696  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  56.62 
 
 
545 aa  648  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  76.19 
 
 
547 aa  891  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4412  glucose-6-phosphate isomerase  60.04 
 
 
549 aa  690  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  56.43 
 
 
545 aa  644  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4478  glucose-6-phosphate isomerase  60.04 
 
 
549 aa  689  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  59.85 
 
 
548 aa  687  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4005  glucose-6-phosphate isomerase  61.51 
 
 
549 aa  698  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.684976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4530  glucose-6-phosphate isomerase  61.51 
 
 
549 aa  698  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  63.08 
 
 
567 aa  746  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  60.11 
 
 
549 aa  688  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  72.39 
 
 
549 aa  828  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  56.62 
 
 
545 aa  645  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.75964e-06  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  59.74 
 
 
549 aa  683  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  61.17 
 
 
549 aa  710  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  57.72 
 
 
550 aa  644  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  59.44 
 
 
546 aa  676  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  63.77 
 
 
552 aa  722  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  57.2 
 
 
545 aa  652  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  61.47 
 
 
541 aa  660  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  56.99 
 
 
545 aa  651  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  59.37 
 
 
551 aa  661  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  60.74 
 
 
550 aa  692  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04050  glucose-6-phosphate isomerase, putative  57.12 
 
 
556 aa  637  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  57.17 
 
 
545 aa  651  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  62.06 
 
 
550 aa  698  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  61.51 
 
 
560 aa  689  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3972  Glucose-6-phosphate isomerase  61.33 
 
 
549 aa  696  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  69.74 
 
 
548 aa  803  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  3.8742e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4486  glucose-6-phosphate isomerase  61.51 
 
 
549 aa  699  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  73.18 
 
 
552 aa  840  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  61.3 
 
 
550 aa  696  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  59.85 
 
 
548 aa  687  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  60.63 
 
 
550 aa  699  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  60.81 
 
 
548 aa  697  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  58.1 
 
 
548 aa  656  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.94926e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03897  glucose-6-phosphate isomerase  61.51 
 
 
549 aa  698  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  60.18 
 
 
549 aa  687  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0230  glucose-6-phosphate isomerase  60.04 
 
 
549 aa  681  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0355158  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  59.93 
 
 
549 aa  684  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  54.61 
 
 
547 aa  628  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  55.15 
 
 
545 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  56.22 
 
 
545 aa  620  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  56.48 
 
 
539 aa  618  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  53.03 
 
 
545 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  54.8 
 
 
545 aa  611  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  54.43 
 
 
554 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  52.88 
 
 
548 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  55.88 
 
 
649 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  54.83 
 
 
547 aa  609  1e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  53.79 
 
 
547 aa  602  1e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0710  glucose-6-phosphate isomerase  56.49 
 
 
543 aa  604  1e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0210645  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  53.31 
 
 
554 aa  601  1e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  53.51 
 
 
554 aa  604  1e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  53.68 
 
 
545 aa  603  1e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  53.32 
 
 
554 aa  603  1e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  55.53 
 
 
545 aa  599  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  52.95 
 
 
554 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  53.69 
 
 
554 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  54.14 
 
 
554 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  53.49 
 
 
554 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  53.23 
 
 
554 aa  601  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  54.33 
 
 
554 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  54.33 
 
 
554 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  52.21 
 
 
545 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  3.81745e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  54.55 
 
 
541 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06037  phosphoglucose isomerase SwoM/PgiA (Eurofung)  56.67 
 
 
553 aa  595  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0281434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  53.69 
 
 
554 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  54.93 
 
 
541 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3177  Glucose-6-phosphate isomerase  54.03 
 
 
548 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00158404  hitchhiker  2.07698e-06 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  53.23 
 
 
554 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4356  glucose-6-phosphate isomerase  55.68 
 
 
543 aa  592  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  52.02 
 
 
545 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  57.14 
 
 
550 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>