More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1338 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
339 aa  701  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  1.41849e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  71.3 
 
 
338 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  64.63 
 
 
346 aa  434  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  56.97 
 
 
337 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  36.6 
 
 
316 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  36.27 
 
 
309 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  39.1 
 
 
386 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  35.6 
 
 
315 aa  184  2e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  33.74 
 
 
353 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.8 
 
 
363 aa  182  5e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  34.3 
 
 
317 aa  182  8e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  37.74 
 
 
336 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  31.69 
 
 
348 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  34.04 
 
 
360 aa  175  1e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.68 
 
 
351 aa  175  1e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  32.32 
 
 
335 aa  173  4e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  32.72 
 
 
328 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  34.42 
 
 
331 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  32.35 
 
 
348 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  31.33 
 
 
371 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 
350 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  30.12 
 
 
342 aa  167  3e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  32.14 
 
 
323 aa  164  1e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  32.14 
 
 
325 aa  165  1e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  32.91 
 
 
365 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.22 
 
 
368 aa  162  8e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.9 
 
 
343 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  34.36 
 
 
339 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  31.91 
 
 
358 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  34.4 
 
 
369 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.92 
 
 
336 aa  156  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.68 
 
 
336 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.69 
 
 
380 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52679e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
345 aa  154  3e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.58 
 
 
345 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  29.79 
 
 
366 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  33.89 
 
 
336 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  34.19 
 
 
353 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  33.01 
 
 
344 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2243  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 
327 aa  146  4e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  32.21 
 
 
308 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  32.01 
 
 
340 aa  141  1e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  30.42 
 
 
362 aa  142  1e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  31.95 
 
 
362 aa  140  2e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  34.45 
 
 
329 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  30.03 
 
 
343 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.88 
 
 
350 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  31.88 
 
 
323 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  34.57 
 
 
346 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  30.56 
 
 
343 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  34.57 
 
 
346 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  30.84 
 
 
332 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  31.52 
 
 
323 aa  137  3e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  32.73 
 
 
342 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  26.18 
 
 
350 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  30.19 
 
 
331 aa  136  6e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  32.65 
 
 
349 aa  135  7e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  30.89 
 
 
339 aa  135  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  29.89 
 
 
352 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.97 
 
 
313 aa  135  9e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  31.18 
 
 
361 aa  135  1e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.3 
 
 
349 aa  134  2e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  31.71 
 
 
333 aa  134  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  27.75 
 
 
349 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  32.34 
 
 
308 aa  133  4e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.75168e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.38 
 
 
361 aa  133  4e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  30.36 
 
 
340 aa  132  1e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  29.64 
 
 
330 aa  131  1e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 
349 aa  131  2e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 
381 aa  131  2e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  31.29 
 
 
335 aa  131  2e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  31.4 
 
 
337 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 
321 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.94 
 
 
350 aa  129  5e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 
350 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 
337 aa  129  8e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 
336 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  28.43 
 
 
312 aa  126  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  30.09 
 
 
344 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 
389 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.69 
 
 
349 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.05 
 
 
308 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.75 
 
 
349 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.37 
 
 
341 aa  123  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 
326 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_002950  PG0309  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  32.71 
 
 
337 aa  122  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.912952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.2 
 
 
370 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.51305e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  34.29 
 
 
310 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  27.99 
 
 
355 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  27.33 
 
 
320 aa  119  5e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 
338 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.13 
 
 
348 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  31.67 
 
 
344 aa  118  1e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  2.74029e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.13 
 
 
348 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  27.81 
 
 
336 aa  119  1e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.13 
 
 
348 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.13 
 
 
348 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  26.3 
 
 
305 aa  118  2e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  28.37 
 
 
338 aa  117  2e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  30.31 
 
 
340 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>