63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1299 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  100 
 
 		 414 aa  843    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  57.78 
 
 		 405 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  38.32 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  36.34 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  39.09 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  36.68 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  38.78 
 
 		 434 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  36.45 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  31.37 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  31.01 
 
 		 378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  32.94 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  36.53 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  33.14 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  29.2 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  31.56 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  29.52 
 
 		 391 aa  172  6.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  28.82 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  29.45 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  31.9 
 
 		 371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  31.07 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.75 
 
 		 454 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  28.41 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.61 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.12 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.52 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  22.57 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.55 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 689 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1626  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 688 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 358 aa  46.6  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  23.12 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  24.58 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23.12 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  19.67 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.4 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  22.54 
 
 		 316 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  27.88 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  32.14 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 315 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  23.17 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2591  ferric siderophore ABC transporter, periplasmic siderophore-binding protein  23.89 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619611  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  23.02 
 
 		 319 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  22.98 
 
 		 322 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  20.56 
 
 		 315 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 324 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  22.96 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02106  hypothetical protein  24.84 
 
 		 327 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  22.78 
 
 		 331 aa  43.1  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  37.33 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  20.38 
 
 		 318 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>