135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1287 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4478  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  39.92 
 
 
252 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0112617  normal  0.137463 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  37.55 
 
 
602 aa  153  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  33.89 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  29.07 
 
 
249 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  27.73 
 
 
258 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  27.31 
 
 
258 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2708  precorrin-6x reductase  30.86 
 
 
253 aa  99.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.154197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2614  precorrin-6x reductase  28.99 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1552  precorrin-6x reductase  27.69 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0296992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0936  precorrin-6x reductase  27.8 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0236244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2202  cobalt-precorrin-6x reductase  28.09 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2248  cobalt-precorrin-6x reductase  28.09 
 
 
263 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2195  cobalt-precorrin-6x reductase  28.09 
 
 
263 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  28.09 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2361  cobalt-precorrin-6x reductase  27.73 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  29.22 
 
 
407 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  30.17 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  29.73 
 
 
655 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  24.78 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  26.97 
 
 
246 aa  82  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1028  precorrin-6x reductase  26.09 
 
 
250 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  27.08 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  25.85 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1095  precorrin-6A reductase  27.03 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  25.97 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3647  precorrin-6x reductase  27.24 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.496702 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1297  precorrin-6x reductase  28.39 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0523  cobalt-precorrin-6x reductase  26.69 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0470  precorrin-6X reductase  30.15 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  27.89 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1621  precorrin-6x reductase  23.87 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.227152  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5134  cobalt-precorrin-6x reductase  26.34 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  30.08 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1007  precorrin-6A reductase  24.64 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  29.84 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  26.91 
 
 
246 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0293  precorrin-6x reductase  24.27 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.326585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  28.45 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  27.72 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  30.08 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1471  precorrin-6x reductase  23.55 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21200  precorrin-6x reductase  26.79 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  30.93 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  25 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  28.93 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  27.54 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  25.21 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  31.84 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  25.78 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  28.23 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  27.51 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  27.39 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  28.99 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  30.22 
 
 
512 aa  65.5  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  28.87 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  28.24 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  26.42 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  26.27 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  26.27 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  25.93 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  24.81 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  25 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  24.9 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  30 
 
 
519 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  24.58 
 
 
246 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  27.13 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  27.13 
 
 
248 aa  62.4  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1223  precorrin-6A reductase  26.83 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218428  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  26.27 
 
 
259 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  27.82 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  28.9 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  27.86 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  28.05 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  26.42 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  26.42 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  24.68 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  26.02 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  28.63 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  27.64 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  32.29 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  24.68 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  27.64 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  24.48 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0220  precorrin-6x reductase  24.62 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  25.79 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  26.48 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  24.7 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  25.39 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1427  cobalt-precorrin-6x reductase  25.21 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0465096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  25.89 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  27.12 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  27.9 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  24.7 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1233  cobalt-precorrin-6x reductase  24.38 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  27.27 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  26.27 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05301  precorrin-6X reductase  24.87 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.221226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0504  precorrin-6X reductase-like  26.15 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  29.26 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>