134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1263 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
235 aa  487  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  68.4 
 
 
250 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.11 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  63.73 
 
 
257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.21 
 
 
309 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.26 
 
 
292 aa  92  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1577  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.11 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000893286  normal  0.294184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2689  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.71 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.68 
 
 
278 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000908265  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0817  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.02 
 
 
295 aa  88.6  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000447964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2219  hypothetical protein  30.21 
 
 
298 aa  85.9  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0511486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  38.33 
 
 
537 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  40.74 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  37.93 
 
 
575 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  41.12 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  34.88 
 
 
568 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2040  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3161  hypothetical protein  30.22 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.93 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  41.59 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  37.96 
 
 
520 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  44.55 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  44.55 
 
 
354 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.13 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  35.65 
 
 
588 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  38.24 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  41.05 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1268  enhanced entry protein EnhA  31.14 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.353847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1098  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.21 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2050  enhanced entry protein  34.44 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.752408  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0142  putative enhanced entry protein EnhA  34.44 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.387138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  43 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1222  enhanced entry protein  31.33 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0332065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.36 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2119  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 
142 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2361  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.18 
 
 
142 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0546  hypothetical protein  26.09 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1236  enhanced entry protein  32.97 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1290  hypothetical protein  31 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.41 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1285  enhanced entry protein EnhA  32.97 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00169403  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  33.63 
 
 
419 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1289  hypothetical protein  33.13 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  39.6 
 
 
519 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1366  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.03 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1402  hypothetical protein  28.85 
 
 
276 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  37.38 
 
 
349 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.39 
 
 
281 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.444945 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2566  enhanced entry protein EnhA  29.63 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  34.86 
 
 
411 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  37.62 
 
 
536 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  36.63 
 
 
503 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2694  enhanced entry protein EnhA  29.01 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.91 
 
 
171 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.21 
 
 
171 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.550997  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  37.62 
 
 
496 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  38.68 
 
 
520 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.31 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 
475 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5894  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.03 
 
 
375 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1788  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.89 
 
 
190 aa  59.3  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.78 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  30.95 
 
 
143 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1314  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.25 
 
 
139 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  34.38 
 
 
408 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0524  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.97 
 
 
177 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  36.79 
 
 
455 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1444  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.12 
 
 
168 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.91 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.04 
 
 
184 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.3 
 
 
376 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.23 
 
 
370 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.89 
 
 
270 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1018  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.82 
 
 
481 aa  52  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.333846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.06 
 
 
291 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.95 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.74 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.71 
 
 
368 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0420468 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
187 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.17 
 
 
374 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10350  hypothetical protein  32.52 
 
 
507 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.228348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.71 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.08 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.67 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.55 
 
 
398 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6095  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.72 
 
 
303 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.04 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.48 
 
 
183 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0912  hypothetical protein  25.83 
 
 
574 aa  49.3  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000369378  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0942  hypothetical protein  46.43 
 
 
185 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.15 
 
 
397 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.69 
 
 
209 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0972  hypothetical protein  46.43 
 
 
185 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30 
 
 
396 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2242  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.29 
 
 
427 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40808  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.83 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.71 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>