52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1216 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  56.41 
 
 		 197 aa  251  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  56.12 
 
 		 196 aa  249  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  59.89 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  55.61 
 
 		 196 aa  241  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  52.04 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  56.42 
 
 		 235 aa  231  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  32.97 
 
 		 264 aa  91.7  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  33.54 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  32.18 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  27.16 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  26.59 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  29.25 
 
 		 461 aa  58.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  32.72 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  34.55 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  30.67 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.32 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.99 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  27.74 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  24.83 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  29.55 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  31.53 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  31.53 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  27.62 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  25.67 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  27.97 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  25.29 
 
 		 263 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  29.86 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  29.9 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  30.36 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  29.9 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  30.21 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  28.19 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  26.53 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.07 
 
 		 263 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  28.39 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  24.62 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  28.04 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  27.64 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  24.06 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  41.67 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  26.84 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  33.04 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  30.33 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  41.67 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  41.67 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  29.03 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  41.67 
 
 		 206 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  25.81 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  23.91 
 
 		 266 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>