81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1187 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1187  PASTA domain containing protein  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000264979  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1452  PASTA domain containing protein  62.39 
 
 
244 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.228352  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  54.51 
 
 
244 aa  254  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0989  PASTA domain-containing protein  50.4 
 
 
244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1533  PASTA domain containing protein  50 
 
 
244 aa  214  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0715242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  47.35 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  42.21 
 
 
242 aa  186  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  29.96 
 
 
692 aa  89.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1368  hypothetical protein  23.14 
 
 
298 aa  85.5  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0294  PASTA domain containing protein  28.17 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0178  PASTA domain containing protein  28.57 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00052168  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
651 aa  73.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2925  PASTA domain containing protein  25.32 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  28.79 
 
 
623 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  23.93 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  27.08 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.28 
 
 
584 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  26.12 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 
612 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.1 
 
 
660 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  27.8 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1643  PASTA domain-containing protein  25.83 
 
 
330 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  30.05 
 
 
660 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 
612 aa  62.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  27.23 
 
 
736 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.07 
 
 
645 aa  61.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.37 
 
 
658 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1835  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.54 
 
 
658 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.192402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.64 
 
 
627 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
582 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  24.28 
 
 
638 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
691 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.44 
 
 
681 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.02 
 
 
652 aa  56.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25.71 
 
 
625 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  27.31 
 
 
530 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.02 
 
 
662 aa  55.8  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.59 
 
 
632 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1203  PASTA domain containing protein  28.18 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 
598 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.82 
 
 
707 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  26.83 
 
 
658 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  28.67 
 
 
334 aa  53.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  26.13 
 
 
672 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08001  hypothetical protein  24.86 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.81 
 
 
667 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  25 
 
 
584 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  28.47 
 
 
323 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.84 
 
 
668 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0391  PASTA domain containing protein  30.63 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.37 
 
 
702 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  26.58 
 
 
691 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.86 
 
 
607 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.03 
 
 
693 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 
666 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0731  hypothetical protein  25.22 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
710 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  26.8 
 
 
618 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.5 
 
 
601 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  25.82 
 
 
501 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 
657 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.02 
 
 
615 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27990  protein kinase family protein with PASTA domain protein  25 
 
 
658 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.210084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.45 
 
 
650 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  24.53 
 
 
634 aa  44.7  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.41 
 
 
676 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
657 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  26.05 
 
 
612 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 
708 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2619  PASTA domain-containing protein  28.1 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  24.88 
 
 
692 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  27.69 
 
 
668 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
723 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.06 
 
 
661 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.64 
 
 
641 aa  42.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.85 
 
 
696 aa  42.4  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.1 
 
 
626 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  31.33 
 
 
367 aa  42.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  23.6 
 
 
646 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  30.41 
 
 
758 aa  42  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.2 
 
 
681 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>