More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1179 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1204  DNA repair protein RadA  73.96 
 
 		 457 aa  668    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0926  DNA repair protein RadA  70.39 
 
 		 455 aa  664    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0778  DNA repair protein RadA  74.51 
 
 		 454 aa  678    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1111  DNA repair protein RadA  72.97 
 
 		 457 aa  655    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 457 aa  931    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0996  DNA repair protein RadA  71.49 
 
 		 456 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1443  DNA repair protein RadA  71.99 
 
 		 454 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  47.59 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  48.46 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  47.61 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  47.39 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  46.29 
 
 		 457 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  46.04 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  47.17 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  46.96 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  46.2 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 457 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  46.74 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  46.14 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  49.42 
 
 		 489 aa  408  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  49.1 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  45.93 
 
 		 454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  47.8 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  45.93 
 
 		 454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  45 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  51.05 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  46.6 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  48.65 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  46.34 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  45.7 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  47.34 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  46.26 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  44.32 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  46.17 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  45.36 
 
 		 455 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  45.62 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  45.57 
 
 		 455 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  45.73 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41070  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  44.7 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  45.67 
 
 		 477 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  43.27 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 455 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  46.67 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  44.42 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  45.89 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  45.35 
 
 		 447 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  44.35 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  45.08 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  49.1 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  45.89 
 
 		 456 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  45.55 
 
 		 457 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  44.86 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  45.89 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  43.94 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  45.43 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  44.98 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  43.94 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  44.1 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  45.83 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0138  DNA repair protein RadA  46.51 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.822754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  44.59 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  43.33 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  43.87 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  45.58 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  45.89 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  47.27 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  45.61 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  46.61 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  45.99 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  45.13 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  43.49 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  45.48 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  42.61 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3556  DNA repair protein RadA  46.05 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  43.92 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2057  DNA repair protein RadA  45.38 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  43.74 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  46.54 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  45.52 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  45.77 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  42.61 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>