More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1086 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  55.3 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1347  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 		 222 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.652945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1057  ATPase  56.56 
 
 		 223 aa  236  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1310  ABC transporter related  52.51 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2457  ABC transporter related  45.81 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.310276  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1728  ABC transporter related  47.57 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.18 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  41.21 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.06 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.06 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  37.06 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  37.06 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.06 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.55 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.55 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.04 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  37.85 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.97 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  38.02 
 
 		 589 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  39.66 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.76 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.76 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.76 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  37.76 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0974  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.31 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 335 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4759  ABC transporter related  40.33 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.81 
 
 		 1323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  39.78 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  36.71 
 
 		 582 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2628  ABC transporter related protein  34.98 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  38.73 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  37 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  36.67 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.41 
 
 		 597 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  37.68 
 
 		 986 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  37.04 
 
 		 625 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  33.49 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  38 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06455  RTX toxin transporter  35 
 
 		 714 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  39.22 
 
 		 734 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.09 
 
 		 329 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  36.18 
 
 		 726 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  35.53 
 
 		 870 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  35.35 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  35.35 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  36.57 
 
 		 206 aa  112  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  34.72 
 
 		 592 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3876  ABC transporter related  36.36 
 
 		 235 aa  111  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  37.36 
 
 		 344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  36.97 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.34 
 
 		 581 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3969  ABC transporter related  36.98 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  33.92 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4079  ABC transporter related  36.98 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03093  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  38.12 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.9 
 
 		 782 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  37.04 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4503  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  31.7 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.55 
 
 		 578 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.55 
 
 		 578 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.4 
 
 		 598 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  39.9 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  35.65 
 
 		 329 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.75 
 
 		 603 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  35.9 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  35.45 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000199498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 		 408 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 		 408 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 		 381 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6304  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 335 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  37.06 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  38.66 
 
 		 592 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  34.06 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1140  ABC transporter related  38.27 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25830  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  33.66 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 		 395 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  36.55 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  34.85 
 
 		 581 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21548  predicted protein  33.5 
 
 		 1360 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.50837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4557  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  31.44 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  37.06 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1195  ABC transporter related  35.23 
 
 		 569 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.399686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>