More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1052 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  58.47 
 
 
591 aa  679    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  59.82 
 
 
567 aa  687    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
566 aa  1164    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  58.36 
 
 
568 aa  671    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  57.91 
 
 
560 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  62.34 
 
 
564 aa  732    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
557 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 
578 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  40.57 
 
 
559 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
566 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
577 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 
565 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 
561 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 
569 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.07 
 
 
561 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.43 
 
 
563 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 
563 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.43 
 
 
563 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 
561 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.43 
 
 
563 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.43 
 
 
582 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 
582 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 
590 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 
549 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.25 
 
 
561 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.95 
 
 
561 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 
584 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 
561 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  37.41 
 
 
591 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
564 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
584 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 
583 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 
585 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
539 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 
585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 
543 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 
551 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
577 aa  352  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
562 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
562 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
573 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 
583 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.14 
 
 
561 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 
561 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  35.78 
 
 
561 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 
583 aa  345  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.78 
 
 
583 aa  345  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.78 
 
 
561 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.78 
 
 
561 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.78 
 
 
561 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  35.78 
 
 
561 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.83 
 
 
561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 
561 aa  342  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
560 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
558 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0735  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 
560 aa  341  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 
559 aa  341  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 
559 aa  340  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.3 
 
 
572 aa  339  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 
559 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 
559 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 
544 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  35.91 
 
 
560 aa  336  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 
561 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.23 
 
 
563 aa  336  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
559 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.48 
 
 
561 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.92 
 
 
557 aa  334  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
561 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 
581 aa  333  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
549 aa  333  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 
554 aa  332  9e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 
569 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
564 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 
577 aa  331  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 
557 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 
557 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 
557 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.92 
 
 
557 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 
551 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 
569 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.88 
 
 
563 aa  330  6e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.38 
 
 
560 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 
563 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  34.24 
 
 
550 aa  329  7e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.12 
 
 
567 aa  329  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.18 
 
 
557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.08 
 
 
557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  33.57 
 
 
569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.92 
 
 
557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.2 
 
 
581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.2 
 
 
554 aa  327  3e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 
572 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35 
 
 
557 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>