120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1051 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1051  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 189 aa  398  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.925098  hitchhiker  0.00013218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1726  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  74.32 
 
 		 185 aa  298  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0528  exonuclease  51.09 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00892328  normal  0.16034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0157  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  24.32 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.32351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  28.19 
 
 		 1443 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1605  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1633  ribonuclease T  26.84 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000360038  hitchhiker  0.000696557 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  26.78 
 
 		 1367 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  26.78 
 
 		 1367 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  30.22 
 
 		 1397 aa  55.5  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1866  ribonuclease T  26.84 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00131644  normal  0.0390394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  27.22 
 
 		 1435 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 		 706 aa  54.7  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1544  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.78 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000802339  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1661  ribonuclease T  26.7 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000109903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  24.31 
 
 		 1390 aa  52  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  26.37 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4200  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.33 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  25.56 
 
 		 1407 aa  51.6  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  28.26 
 
 		 551 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0766  CRISPR-associated endoribonuclease Cas2  26.29 
 
 		 359 aa  50.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0695815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.78 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  28.57 
 
 		 590 aa  49.3  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.33 
 
 		 944 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4438  exonuclease I  29.53 
 
 		 476 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  24.16 
 
 		 1433 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  24.86 
 
 		 1433 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  24.86 
 
 		 1433 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  24.16 
 
 		 1433 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  24.16 
 
 		 1433 aa  47.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  24.16 
 
 		 1433 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  24.16 
 
 		 1433 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  24.16 
 
 		 1433 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  24.16 
 
 		 1433 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  23.89 
 
 		 970 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  27.17 
 
 		 570 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  24.29 
 
 		 1449 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2268  ribonuclease T  31.45 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.862019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  24.08 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0208649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  24.43 
 
 		 1449 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.07 
 
 		 595 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56080  exonuclease I  27.08 
 
 		 480 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2024  Rad3-related DNA helicase  25.99 
 
 		 791 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.323186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2627  exonuclease I  26.98 
 
 		 476 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0145209  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.67 
 
 		 927 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2302  exonuclease I  26.7 
 
 		 475 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2944  exonuclease I  26.18 
 
 		 474 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000391872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01914  exonuclease I  26.32 
 
 		 475 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2313  exonuclease I  30.1 
 
 		 476 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1049  exonuclease I  26.32 
 
 		 475 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01900  hypothetical protein  26.32 
 
 		 475 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  24.73 
 
 		 1444 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  23.87 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  26.52 
 
 		 1432 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  22.91 
 
 		 714 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  25.56 
 
 		 1433 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  24.52 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2149  exonuclease I  26.7 
 
 		 475 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1629  exonuclease I  26.32 
 
 		 475 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.186939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.63 
 
 		 605 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1646  Exodeoxyribonuclease I  26.7 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  25.27 
 
 		 578 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1607  DNA polymerase III subunit epsilon  29.61 
 
 		 266 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.08 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  28.09 
 
 		 1437 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  24.08 
 
 		 1437 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2450  ribonuclease T  27.52 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299626  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  24.59 
 
 		 1433 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.97 
 
 		 921 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0954  exonuclease I  28.8 
 
 		 488 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364121  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1221  exonuclease I  26.7 
 
 		 475 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.171451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2291  exonuclease I  26.49 
 
 		 476 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.057719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.27 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2211  exonuclease I  28.96 
 
 		 476 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  23.46 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  26.92 
 
 		 574 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0501  ribonuclease T  26.36 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2436  exodeoxyribonuclease I  25.68 
 
 		 486 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4884  exonuclease I  26.84 
 
 		 478 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0837  exonuclease I  28.8 
 
 		 478 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  24.1 
 
 		 315 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.32 
 
 		 328 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1611  exonuclease I  25.39 
 
 		 482 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  26.29 
 
 		 897 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  26.63 
 
 		 954 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  26.29 
 
 		 897 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2420  exonuclease I  28.26 
 
 		 476 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  26.37 
 
 		 585 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3083  exonuclease I  28.26 
 
 		 487 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2516  exonuclease I  28.26 
 
 		 476 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0597  ribonuclease T  27.83 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0238382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  25.41 
 
 		 1442 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  23.84 
 
 		 299 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1005  exonuclease I  25.93 
 
 		 478 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000425826  hitchhiker  0.00000000000101458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2244  exonuclease I  25.95 
 
 		 476 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0792988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2293  exonuclease I  25.95 
 
 		 476 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.083506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2191  exonuclease I  25.95 
 
 		 476 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.343372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2404  exonuclease I  25.95 
 
 		 476 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.191485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  26.59 
 
 		 616 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  23.73 
 
 		 574 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>