More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1014 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  79.06 
 
 
451 aa  736  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  87.53 
 
 
449 aa  801  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  100 
 
 
449 aa  900  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.30193e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  81.96 
 
 
449 aa  754  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  5.14832e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  81.07 
 
 
449 aa  749  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.93601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  79.96 
 
 
449 aa  732  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  8.05339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  81.29 
 
 
449 aa  747  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  2.65163e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  58.96 
 
 
450 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  58.16 
 
 
439 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  56 
 
 
443 aa  501  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  55.86 
 
 
440 aa  494  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  55.2 
 
 
446 aa  493  1e-138  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  55.73 
 
 
441 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  56.78 
 
 
445 aa  479  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  55.66 
 
 
446 aa  471  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  8.59311e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  57.04 
 
 
442 aa  471  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  57.18 
 
 
442 aa  467  1e-130  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  53.05 
 
 
442 aa  465  1e-130  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  53.19 
 
 
453 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.77324e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  51.96 
 
 
446 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  6.90531e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  51.98 
 
 
479 aa  459  1e-128  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  55.74 
 
 
450 aa  460  1e-128  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  55.45 
 
 
452 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.07321e-08  hitchhiker  1.41752e-06 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  54.55 
 
 
433 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  54.11 
 
 
444 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  53.64 
 
 
451 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.52662e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  54.09 
 
 
433 aa  455  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.21808e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  53.05 
 
 
445 aa  451  1e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  1.88375e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.93 
 
 
447 aa  452  1e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.70112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  53.09 
 
 
443 aa  449  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  53.21 
 
 
447 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.8858e-09  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  52.33 
 
 
450 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.92246e-06  unclonable  2.76763e-08 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  53.13 
 
 
443 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  51.69 
 
 
449 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  53.07 
 
 
448 aa  445  1e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  53.57 
 
 
463 aa  447  1e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.52943e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  51.84 
 
 
459 aa  446  1e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  55.23 
 
 
452 aa  447  1e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  54.32 
 
 
449 aa  445  1e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.80679e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  53.72 
 
 
445 aa  446  1e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  9.11633e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  53.33 
 
 
435 aa  441  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  1.2194e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  51.69 
 
 
443 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.09658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  51.16 
 
 
518 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  50.23 
 
 
439 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  2.88102e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  51.16 
 
 
449 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.6406e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  54 
 
 
453 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  3.27935e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  53.57 
 
 
434 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  53.78 
 
 
453 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  48.78 
 
 
508 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  51.39 
 
 
449 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.43009e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  51.39 
 
 
449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  51.16 
 
 
449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.57828e-07  unclonable  2.8199e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  51.16 
 
 
449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  51.39 
 
 
449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.28008e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.23 
 
 
481 aa  432  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  4.91114e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  51.16 
 
 
449 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  4.08298e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  51.39 
 
 
449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  3.47799e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  51.39 
 
 
449 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.32061e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  51.39 
 
 
449 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16729e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  51.16 
 
 
449 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.61017e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  49.67 
 
 
492 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  51.04 
 
 
455 aa  433  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  7.9449e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  52.8 
 
 
485 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.77 
 
 
470 aa  431  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  52.79 
 
 
452 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.16081e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  50 
 
 
455 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  4.65855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  54.87 
 
 
462 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  50 
 
 
455 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  3.99025e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  52.62 
 
 
448 aa  427  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.38232e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  52.64 
 
 
453 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  9.44997e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.23 
 
 
507 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  51.17 
 
 
444 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  53.27 
 
 
458 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  52.16 
 
 
457 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.42989e-05  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.58 
 
 
491 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  46.97 
 
 
449 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.64274e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  51.76 
 
 
444 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.95764e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  53.27 
 
 
458 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  52.42 
 
 
459 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.57 
 
 
446 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.41723e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  52.39 
 
 
472 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.77 
 
 
512 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  49.54 
 
 
446 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.40128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  50 
 
 
512 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  51.29 
 
 
490 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.66323e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  50.94 
 
 
444 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  51.07 
 
 
454 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.93458e-05  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  51.07 
 
 
454 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3424  signal recognition particle protein  50.69 
 
 
524 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  49.53 
 
 
469 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  50.7 
 
 
478 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.97976e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  51.03 
 
 
457 aa  417  1e-115  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  50.23 
 
 
436 aa  416  1e-115  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.6303e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  51.38 
 
 
457 aa  415  1e-115  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2229  signal recognition particle protein  48.86 
 
 
527 aa  416  1e-115  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.29631e-10 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1510  signal recognition particle protein  50.57 
 
 
515 aa  417  1e-115  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  48.05 
 
 
441 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  50.57 
 
 
457 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.24707e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.38 
 
 
447 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  50 
 
 
452 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.61061e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>