More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0951 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
393 aa  801    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  46.38 
 
 
412 aa  332  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 
432 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 
438 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 
408 aa  220  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  36.32 
 
 
420 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  30.22 
 
 
450 aa  155  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.31 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.36 
 
 
408 aa  153  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.34 
 
 
442 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 
447 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  28.5 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.74 
 
 
264 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.73 
 
 
449 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.96 
 
 
576 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.44 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.4 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.53 
 
 
1191 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 
333 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.67 
 
 
401 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  27.38 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  41.01 
 
 
184 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.57 
 
 
277 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.65 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  28.27 
 
 
844 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.3 
 
 
332 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  38.15 
 
 
216 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.43 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.94 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.94 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  29.47 
 
 
862 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.72 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  42.64 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  27.03 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  28.34 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  31.67 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  30.5 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.36 
 
 
214 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  27.39 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  27.24 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  35.19 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  26.67 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 
319 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.56 
 
 
389 aa  77  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  23.74 
 
 
635 aa  76.6  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  28.69 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  29.89 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.74 
 
 
872 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.97 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  23.42 
 
 
348 aa  76.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  25.92 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  33.99 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  25.92 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  33.54 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.1 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  30.15 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  33.96 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  34.23 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  28.28 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  29.73 
 
 
880 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  30.4 
 
 
877 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  37.33 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  30.85 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.66 
 
 
521 aa  73.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
880 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  33.17 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
880 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
880 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 
880 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 
866 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 
872 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  27.18 
 
 
776 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.23 
 
 
517 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  33.56 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 
825 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 
862 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 
123 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  26.75 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  34.94 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  26.75 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 
825 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 
825 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 
825 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 
825 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.36 
 
 
825 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  21.95 
 
 
607 aa  70.5  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.31 
 
 
1033 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  34.94 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.7 
 
 
870 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  27.58 
 
 
483 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  33.73 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>