More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0922 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  221  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  85.05 
 
 
109 aa  198  2e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  86.79 
 
 
109 aa  197  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  84.91 
 
 
109 aa  194  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  81.31 
 
 
109 aa  191  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  79.44 
 
 
109 aa  188  3e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  7.55865e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  79.25 
 
 
114 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  73.83 
 
 
110 aa  171  3e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  63.55 
 
 
106 aa  151  3e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.22 
 
 
115 aa  146  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  58.25 
 
 
105 aa  140  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  56.31 
 
 
114 aa  136  9e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  59.81 
 
 
105 aa  136  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  59.26 
 
 
106 aa  135  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  61.39 
 
 
107 aa  134  3e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  58.25 
 
 
105 aa  135  3e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  56.07 
 
 
110 aa  134  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  58.76 
 
 
109 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  61.68 
 
 
104 aa  133  6e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  56 
 
 
107 aa  133  7e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  59.81 
 
 
104 aa  133  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  56.88 
 
 
104 aa  132  1e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  55.34 
 
 
105 aa  132  1e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  59.81 
 
 
104 aa  131  2e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  57.94 
 
 
104 aa  132  2e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  132  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  57.94 
 
 
104 aa  132  2e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  54 
 
 
107 aa  130  8e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  57.94 
 
 
105 aa  130  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  129  1e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  129  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  129  1e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  55 
 
 
106 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  127  4e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  127  4e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  127  4e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  49.53 
 
 
148 aa  127  5e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  54.21 
 
 
104 aa  127  5e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  56.44 
 
 
105 aa  127  7e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  126  8e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  125  1e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  53 
 
 
107 aa  126  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  126  1e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  126  1e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  58.25 
 
 
107 aa  126  1e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  53.33 
 
 
108 aa  125  1e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  56.25 
 
 
107 aa  125  2e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  125  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  125  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  53.06 
 
 
105 aa  125  2e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  55.67 
 
 
107 aa  124  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.21 
 
 
107 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  52.48 
 
 
107 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  53.47 
 
 
110 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  51.92 
 
 
150 aa  124  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  53.47 
 
 
110 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  55.34 
 
 
104 aa  123  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  123  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  123  8e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  51.92 
 
 
106 aa  123  8e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  51.46 
 
 
109 aa  123  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  123  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  55.1 
 
 
106 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.71604e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52.43 
 
 
108 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  54.08 
 
 
119 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  51.43 
 
 
108 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.15955e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.36523e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  49.06 
 
 
109 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  50.5 
 
 
125 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  54.08 
 
 
106 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  47.66 
 
 
124 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  52.48 
 
 
133 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  52 
 
 
123 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  9.46631e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  52 
 
 
106 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  51.96 
 
 
113 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  57 
 
 
104 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  54.17 
 
 
107 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  57 
 
 
104 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  49.5 
 
 
110 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  53.61 
 
 
107 aa  121  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  121  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>