71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0918 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  100 
 
 
399 aa  811    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  68.92 
 
 
399 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  58.35 
 
 
467 aa  473  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  55.5 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  56.5 
 
 
400 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  55.58 
 
 
399 aa  428  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  58.04 
 
 
400 aa  425  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  36.44 
 
 
1085 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  33.92 
 
 
531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.88 
 
 
341 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  26.22 
 
 
772 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  28.09 
 
 
347 aa  92.8  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.47 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.47 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.82 
 
 
1351 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  28.27 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  24.55 
 
 
1088 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  24.23 
 
 
1112 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  24.23 
 
 
1070 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  31.25 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  24.23 
 
 
1070 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  23.87 
 
 
760 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  23.46 
 
 
760 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  21.93 
 
 
995 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29 
 
 
1266 aa  83.6  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  25.1 
 
 
565 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  24.61 
 
 
1052 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  22.32 
 
 
755 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  24.11 
 
 
766 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  33.19 
 
 
498 aa  79.3  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  24.11 
 
 
772 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  22.32 
 
 
766 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  21.26 
 
 
993 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.26 
 
 
765 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  26.26 
 
 
542 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.26 
 
 
779 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  27.11 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  25.41 
 
 
643 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  19.2 
 
 
994 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  20 
 
 
1012 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  27.41 
 
 
877 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 
789 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 
789 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  32.43 
 
 
858 aa  73.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  20.65 
 
 
1011 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  19.2 
 
 
954 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  26.19 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  26.51 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  27.85 
 
 
312 aa  67  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  31.03 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  31.31 
 
 
587 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.69 
 
 
344 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  28.18 
 
 
1290 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.87 
 
 
1086 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  30.6 
 
 
718 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  29.82 
 
 
197 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  30.22 
 
 
374 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  30.43 
 
 
205 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  25.1 
 
 
692 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  27.33 
 
 
1231 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  22.1 
 
 
211 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  28.19 
 
 
618 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  27.33 
 
 
254 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5088  internalin G  27.55 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  29.65 
 
 
631 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0153  internalin G  26.5 
 
 
267 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  27.22 
 
 
279 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  30.71 
 
 
238 aa  46.6  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  24.73 
 
 
474 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1105  hypothetical protein  25.15 
 
 
314 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000125481  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0331  hypothetical protein  28.72 
 
 
290 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>